248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1405 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 193 aa  391  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  66.84 
 
 		 193 aa  265  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  59.07 
 
 		 193 aa  251  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  59.59 
 
 		 193 aa  240  7.999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  58.93 
 
 		 180 aa  209  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  49.18 
 
 		 194 aa  186  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  45.85 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  44.31 
 
 		 191 aa  158  4e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  40.76 
 
 		 190 aa  154  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  40.83 
 
 		 187 aa  137  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  37.57 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  35.87 
 
 		 197 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  35.29 
 
 		 192 aa  131  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  40.99 
 
 		 214 aa  127  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  34.62 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  39.41 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  35.76 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  30.73 
 
 		 199 aa  94.7  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 195 aa  93.6  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2591  pentapeptide repeat-containing protein  31.58 
 
 		 204 aa  87.8  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  30.81 
 
 		 196 aa  86.3  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  31.55 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  30.05 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  30.05 
 
 		 208 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  30.05 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  29.17 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  31.21 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  31.21 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  29.76 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  31.21 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  30.64 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  26.56 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  31.14 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  29.94 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  32.21 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  34.68 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  31.58 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  34.68 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  34.68 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  34.68 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  32.82 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  34.68 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  34.68 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  25.14 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  31.25 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  29.22 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  33.58 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  29.48 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  31.82 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  31.82 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  31.82 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  27.4 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  28.32 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  27.12 
 
 		 976 aa  58.9  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  29.69 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  24.83 
 
 		 381 aa  58.9  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  29.53 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  27.46 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  25.48 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  25.79 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  27.05 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  26.23 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  25.5 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000904  hypothetical protein  31.01 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  24.07 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  26.4 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  27.92 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5828  pentapeptide repeat protein  27.21 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510799  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  23.72 
 
 		 363 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  22.6 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  25.47 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  25.53 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  28.06 
 
 		 844 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  26.19 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  28.93 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  24.85 
 
 		 355 aa  52.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  27.91 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  30.28 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  28.99 
 
 		 452 aa  52.4  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  28.07 
 
 		 412 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  25.76 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  25.43 
 
 		 739 aa  51.6  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  30.53 
 
 		 286 aa  51.6  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  23.67 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  25.43 
 
 		 739 aa  51.6  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  25.43 
 
 		 739 aa  51.6  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  27.5 
 
 		 242 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  29.93 
 
 		 218 aa  51.2  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  32.29 
 
 		 576 aa  51.2  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  26.53 
 
 		 332 aa  51.2  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  29.71 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  27.21 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  27.66 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  29.14 
 
 		 285 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  28.24 
 
 		 567 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0798  hypothetical protein  30 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  25.73 
 
 		 949 aa  50.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  26.74 
 
 		 261 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  24.39 
 
 		 370 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  26.9 
 
 		 600 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>