119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3404 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
192 aa  376  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  36.98 
 
 
193 aa  135  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  37.31 
 
 
197 aa  132  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  35.29 
 
 
193 aa  131  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  37.02 
 
 
190 aa  127  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  37.84 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  35.47 
 
 
214 aa  122  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  36.97 
 
 
187 aa  121  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  35.64 
 
 
190 aa  117  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  32.63 
 
 
194 aa  115  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  38.85 
 
 
180 aa  115  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  37.2 
 
 
193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  31.63 
 
 
206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  32.98 
 
 
191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  36.31 
 
 
187 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  32.79 
 
 
185 aa  99  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
199 aa  89  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  28.96 
 
 
196 aa  87  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  28.02 
 
 
186 aa  85.5  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  31.89 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  31.87 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  30.27 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2591  pentapeptide repeat-containing protein  31.47 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  29.73 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  29.9 
 
 
265 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  30.68 
 
 
199 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  29.73 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  29.73 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  29.73 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  29.03 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  29.73 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  23.29 
 
 
227 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  28.12 
 
 
194 aa  62.4  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  26.74 
 
 
191 aa  62.4  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  27.07 
 
 
206 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  28.66 
 
 
198 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  23.3 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  22.29 
 
 
229 aa  58.9  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  22.86 
 
 
197 aa  57.8  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  27.45 
 
 
205 aa  57.8  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  25.66 
 
 
211 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  22.58 
 
 
229 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  21.47 
 
 
183 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 
739 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 
739 aa  53.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 
739 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  25.4 
 
 
200 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  25 
 
 
211 aa  52  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  25 
 
 
211 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  28.3 
 
 
356 aa  52  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  24.66 
 
 
976 aa  51.2  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  25.14 
 
 
949 aa  50.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  27.81 
 
 
359 aa  50.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  20.9 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3355  pentapeptide repeat-containing protein  28.16 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  22.79 
 
 
218 aa  49.7  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  22.98 
 
 
452 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  21.13 
 
 
452 aa  48.5  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  22.67 
 
 
370 aa  48.5  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  27.21 
 
 
233 aa  47.4  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  21.3 
 
 
193 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  24.82 
 
 
356 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  20.4 
 
 
204 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  18.92 
 
 
225 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  20 
 
 
456 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  25 
 
 
218 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  23.68 
 
 
211 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  20.2 
 
 
360 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  21.65 
 
 
360 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  21.25 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  21.25 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  20.2 
 
 
360 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  20.2 
 
 
360 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  21.56 
 
 
360 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  21.25 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  27.37 
 
 
218 aa  46.2  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  24.82 
 
 
211 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  22.66 
 
 
227 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  20.62 
 
 
360 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  22.87 
 
 
223 aa  45.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  24.18 
 
 
216 aa  45.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  23.08 
 
 
218 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  22.36 
 
 
485 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  23.08 
 
 
355 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  24.44 
 
 
452 aa  45.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  22.36 
 
 
453 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  23.03 
 
 
211 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1438  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
202 aa  44.7  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0273991  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  21.25 
 
 
183 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  22.03 
 
 
233 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000904  hypothetical protein  24.68 
 
 
216 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  20 
 
 
576 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  25.5 
 
 
213 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  26 
 
 
217 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  19.55 
 
 
186 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  20 
 
 
367 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  20 
 
 
367 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0752  pentapeptide repeat protein  26.09 
 
 
714 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  24.82 
 
 
358 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  22.7 
 
 
363 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>