181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1489 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 187 aa  380  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  40.66 
 
 		 190 aa  157  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 		 190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  40.85 
 
 		 197 aa  137  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  37.22 
 
 		 193 aa  134  7.000000000000001e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  36.81 
 
 		 193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  35.16 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  39.39 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  42.07 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  34.62 
 
 		 193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  34.62 
 
 		 191 aa  124  6e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  32.97 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  36.97 
 
 		 192 aa  121  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  37.8 
 
 		 194 aa  115  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  36.11 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  32.93 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  32.74 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  31.18 
 
 		 195 aa  89.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  30.72 
 
 		 199 aa  88.2  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2591  pentapeptide repeat-containing protein  28.49 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  30.43 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  27.51 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  27.51 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  27.42 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  29.44 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  27.59 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  27.81 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  27.42 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  29.58 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  27.42 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  27.62 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  27.42 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  30.11 
 
 		 211 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  30.11 
 
 		 211 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  30.11 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  27.91 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  29.03 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  29.03 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  28.49 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  27.86 
 
 		 355 aa  62  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  27.91 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  30 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  26.87 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  24.08 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  26.67 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  31.58 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  26.85 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  28.26 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  26.19 
 
 		 949 aa  54.3  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  28.24 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  26.67 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  23.78 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  27.52 
 
 		 392 aa  52  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  26.22 
 
 		 452 aa  52  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  29.5 
 
 		 359 aa  51.6  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  27.66 
 
 		 197 aa  51.2  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  29.06 
 
 		 976 aa  50.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  24.68 
 
 		 370 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  34.65 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  30.14 
 
 		 961 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  28.21 
 
 		 381 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  24.85 
 
 		 360 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  24.39 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  27.27 
 
 		 401 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  28.24 
 
 		 452 aa  50.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  27.27 
 
 		 401 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  24.83 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  24.42 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  22.45 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  27.7 
 
 		 360 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  27.7 
 
 		 360 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  27.7 
 
 		 360 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  24.85 
 
 		 360 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  24.85 
 
 		 360 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  25.49 
 
 		 295 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  34.94 
 
 		 242 aa  48.5  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  25.19 
 
 		 221 aa  48.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  23.94 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  29.41 
 
 		 233 aa  48.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  24.22 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  24.24 
 
 		 734 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  22.42 
 
 		 191 aa  48.1  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1438  pentapeptide repeat protein  28.03 
 
 		 202 aa  48.1  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0273991  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  23.91 
 
 		 224 aa  48.1  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0798  hypothetical protein  25.15 
 
 		 171 aa  47.8  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  24.63 
 
 		 517 aa  47.8  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  27.64 
 
 		 456 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1028  pentapeptide repeat-containing protein  26.5 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.22421  normal  0.0351171 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  27.27 
 
 		 349 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  25.14 
 
 		 223 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  25.44 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2083  hypothetical protein  32.32 
 
 		 738 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1892  hypothetical protein  32.32 
 
 		 716 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  25.15 
 
 		 846 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2466  pentapeptide repeat-containing protein  27.35 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0798  hypothetical protein  32.32 
 
 		 738 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  23.53 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0710  hypothetical protein  32.32 
 
 		 738 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2008  hypothetical protein  32.32 
 
 		 738 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  25 
 
 		 261 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>