197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2486 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
190 aa  385  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  41.8 
 
 
190 aa  159  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  40.66 
 
 
187 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  40.96 
 
 
197 aa  156  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  39.78 
 
 
193 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  39.66 
 
 
193 aa  141  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  38.12 
 
 
193 aa  139  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  37.08 
 
 
180 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  35.91 
 
 
214 aa  137  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  37.57 
 
 
193 aa  137  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  36.26 
 
 
194 aa  134  9e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  38.51 
 
 
186 aa  132  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  37.02 
 
 
192 aa  127  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  40.24 
 
 
187 aa  124  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  38.32 
 
 
185 aa  123  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  37.58 
 
 
191 aa  123  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  27.8 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  30.53 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2591  pentapeptide repeat-containing protein  30.98 
 
 
204 aa  95.1  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  29.1 
 
 
196 aa  94.7  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  29.57 
 
 
199 aa  89.4  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  28.72 
 
 
220 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  28.72 
 
 
225 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  29.03 
 
 
220 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  30.23 
 
 
195 aa  85.5  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  30.59 
 
 
265 aa  85.5  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  27.66 
 
 
220 aa  84.7  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  31.18 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  29.41 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  29.41 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  28.82 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  31.95 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  31.55 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  31.55 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  31.95 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  31.55 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  31.36 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  30.11 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  28.33 
 
 
360 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  28.33 
 
 
360 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  28.33 
 
 
360 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  34.01 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  27.78 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  27.78 
 
 
360 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  27.78 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  23.37 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  24.82 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 
183 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  25.17 
 
 
205 aa  62.4  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  25.64 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  20.11 
 
 
191 aa  60.5  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  23.97 
 
 
358 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0798  hypothetical protein  32.31 
 
 
171 aa  60.5  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  25.64 
 
 
215 aa  58.5  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  25.49 
 
 
200 aa  58.5  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  27.08 
 
 
227 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  26.53 
 
 
200 aa  58.2  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  23.76 
 
 
229 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  23.31 
 
 
739 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  26.62 
 
 
183 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  26.62 
 
 
183 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  23.31 
 
 
739 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  26.62 
 
 
183 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  26.22 
 
 
204 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  23.31 
 
 
739 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  20.51 
 
 
229 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  23.35 
 
 
218 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  24.38 
 
 
343 aa  55.1  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  23.66 
 
 
218 aa  55.5  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  26.71 
 
 
359 aa  55.1  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  21.79 
 
 
355 aa  55.1  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  25.14 
 
 
370 aa  55.1  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2059  pentapeptide repeat-containing protein  27.59 
 
 
214 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  22.92 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  28.57 
 
 
261 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  27.27 
 
 
217 aa  53.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  25 
 
 
886 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  27.27 
 
 
242 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  25.85 
 
 
363 aa  52  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  26.12 
 
 
949 aa  52  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  25.45 
 
 
356 aa  51.6  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  22.22 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  24.12 
 
 
348 aa  50.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  25.16 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1028  pentapeptide repeat-containing protein  21.83 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.22421  normal  0.0351171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  25.62 
 
 
245 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  22.56 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  20.98 
 
 
215 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  20.57 
 
 
381 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  24.62 
 
 
200 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  26.62 
 
 
844 aa  49.3  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 
354 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 
354 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  21.62 
 
 
576 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  23.44 
 
 
567 aa  49.3  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  23.93 
 
 
242 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  20.92 
 
 
197 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  23.42 
 
 
183 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2824  hypothetical protein  32.53 
 
 
356 aa  48.5  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  23.96 
 
 
218 aa  48.5  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>