207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3729 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  403  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  41.5 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1181  pentapeptide repeat protein  28.34 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.329473 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  27.72 
 
 		 215 aa  91.3  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  32.07 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  29.24 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  26.23 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  28.85 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  28.4 
 
 		 211 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  28.4 
 
 		 211 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  27.81 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  23.37 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  27.72 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  27.72 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  27.72 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  27.22 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  27.62 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  26.2 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  27.22 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  25.57 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  26.7 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  22.8 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  23.33 
 
 		 739 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  23.33 
 
 		 739 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  24.48 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  26.63 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  23.33 
 
 		 739 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  25.7 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  24.29 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  21.89 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  24.49 
 
 		 265 aa  58.2  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  23.76 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  22.34 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  23.46 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  21.67 
 
 		 844 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2591  pentapeptide repeat-containing protein  26.42 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  24.87 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  23.81 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  20.47 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  24.4 
 
 		 363 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  25.42 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  24.87 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  29.2 
 
 		 452 aa  53.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  20.77 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  22.75 
 
 		 949 aa  53.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  23.88 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  24.34 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  24.39 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  22.12 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  22.94 
 
 		 366 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  22.94 
 
 		 366 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2386  hypothetical protein  20.1 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.193618 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  24.58 
 
 		 348 aa  52.4  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  24 
 
 		 320 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  25.97 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  24.31 
 
 		 229 aa  52  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  25.82 
 
 		 448 aa  51.6  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  25.41 
 
 		 208 aa  51.6  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  23.78 
 
 		 881 aa  51.6  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  24.36 
 
 		 355 aa  51.6  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  22.95 
 
 		 825 aa  51.6  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  25 
 
 		 343 aa  51.2  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  20.57 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  23.94 
 
 		 199 aa  51.2  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  24.29 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1438  pentapeptide repeat protein  24.81 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0273991  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  28.97 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  22.75 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  19.88 
 
 		 381 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  23.95 
 
 		 872 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  19.25 
 
 		 309 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  25.64 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  21.92 
 
 		 420 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  23.72 
 
 		 370 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  22.35 
 
 		 366 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  22.4 
 
 		 825 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2059  pentapeptide repeat-containing protein  20.32 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  22.4 
 
 		 862 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  22.4 
 
 		 825 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  22.4 
 
 		 825 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  22.4 
 
 		 825 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  22.4 
 
 		 825 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  24.62 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  21.08 
 
 		 267 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  20.4 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0798  hypothetical protein  24.24 
 
 		 171 aa  49.3  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  24.74 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3619  pentapeptide repeat protein  23.95 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0594601  decreased coverage  0.000131742 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4564  hypothetical protein  25.37 
 
 		 277 aa  48.9  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  23.24 
 
 		 220 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35000  uncharacterized low-complexity protein  22.55 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  22.53 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  25.29 
 
 		 360 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  19.86 
 
 		 295 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  25.29 
 
 		 360 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  21.8 
 
 		 846 aa  48.1  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  25 
 
 		 191 aa  48.1  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  27.74 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  22.53 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>