60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4564 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4564  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4500  hypothetical protein  89.13 
 
 		 512 aa  507  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3955  conserved hypothetical protein  92.61 
 
 		 442 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03870  hypothetical protein  92.61 
 
 		 442 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03910  hypothetical protein  92.61 
 
 		 442 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.97097  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5519  hypothetical protein  83.33 
 
 		 526 aa  471  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0795524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4278  hypothetical protein  92.71 
 
 		 431 aa  472  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.848192  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  23.65 
 
 		 456 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  23.53 
 
 		 976 aa  53.5  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  20.47 
 
 		 567 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  22.04 
 
 		 844 aa  50.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  22.09 
 
 		 348 aa  49.7  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  25.37 
 
 		 200 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0449  pentapeptide repeat protein  33.66 
 
 		 198 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00280297  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  28.28 
 
 		 949 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  25.23 
 
 		 359 aa  47.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  22.56 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  22.56 
 
 		 211 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  20.74 
 
 		 452 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  24.58 
 
 		 211 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  22.45 
 
 		 432 aa  47  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  22.56 
 
 		 211 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  24.71 
 
 		 327 aa  46.6  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  21.95 
 
 		 349 aa  46.6  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  23.42 
 
 		 363 aa  46.2  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  20 
 
 		 449 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  22.6 
 
 		 367 aa  45.8  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  22.6 
 
 		 367 aa  45.8  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  19.89 
 
 		 354 aa  45.8  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  26.5 
 
 		 211 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  19.86 
 
 		 174 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  26.09 
 
 		 355 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  19.33 
 
 		 576 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  25.64 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  23.4 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  21.54 
 
 		 343 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  21.47 
 
 		 381 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  24.18 
 
 		 370 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  21.54 
 
 		 343 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  22.36 
 
 		 442 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6262  pentapeptide repeat-containing protein  22.47 
 
 		 408 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104366  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  22 
 
 		 215 aa  43.9  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2588  pentapeptide repeat-containing protein  29.63 
 
 		 162 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  25.58 
 
 		 193 aa  43.5  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  20.57 
 
 		 291 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  20.57 
 
 		 291 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  23.08 
 
 		 452 aa  43.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  20.9 
 
 		 354 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3427  pentapeptide repeat-containing protein  22.58 
 
 		 365 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  20.9 
 
 		 354 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  20.9 
 
 		 354 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  20.9 
 
 		 354 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  20.9 
 
 		 354 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2141  pentapeptide repeat-containing protein  20 
 
 		 222 aa  42.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  23.96 
 
 		 493 aa  42.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0313  hypothetical protein  25.56 
 
 		 170 aa  42.4  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.967815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  23.03 
 
 		 242 aa  42.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  19.74 
 
 		 336 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  19.74 
 
 		 336 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  23.23 
 
 		 215 aa  42  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>