185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2490 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 196 aa  403  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  50.26 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  50.26 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  49.74 
 
 		 220 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  50.26 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  48.95 
 
 		 265 aa  191  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  50.53 
 
 		 208 aa  191  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  50.53 
 
 		 208 aa  191  8e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  49.47 
 
 		 208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2591  pentapeptide repeat-containing protein  46.43 
 
 		 204 aa  187  7e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  46.84 
 
 		 199 aa  181  7e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  41.97 
 
 		 199 aa  167  9e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  47.49 
 
 		 195 aa  159  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  34.04 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  35.12 
 
 		 180 aa  104  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  30.53 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  35.09 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  34.91 
 
 		 185 aa  97.1  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  32.74 
 
 		 193 aa  95.1  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  29.1 
 
 		 190 aa  94.7  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  28.96 
 
 		 192 aa  87  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  30.81 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  31.4 
 
 		 193 aa  84.3  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  30.43 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  31.33 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  29.73 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  29.79 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  29.73 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  28.12 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  29.7 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  27.38 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  25.74 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  25.7 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  25.12 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  26.04 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  24.86 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  24.86 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  24.86 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  24.26 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  28.65 
 
 		 348 aa  58.9  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  24.88 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  25.51 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  26.82 
 
 		 356 aa  58.2  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  23.76 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  23.08 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  24.5 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  23.76 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  25.88 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  24 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  28.66 
 
 		 358 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  26.63 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  23.38 
 
 		 449 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  24.86 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  25.91 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  25.9 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  22.61 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  25.3 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  23.83 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  26.03 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3692  pentapeptide repeat-containing protein  25.12 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.413415  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  24.46 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0448  pentapeptide repeat-containing protein  27.62 
 
 		 356 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513486  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  24.16 
 
 		 381 aa  55.1  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2084  pentapeptide repeat-containing protein  27.62 
 
 		 356 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0738  pentapeptide repeat-containing protein  27.62 
 
 		 356 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1033  pentapeptide repeat-containing protein  27.62 
 
 		 356 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  24.14 
 
 		 734 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0799  hypothetical protein  27.62 
 
 		 356 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0711  hypothetical protein  27.62 
 
 		 356 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2007  pentapeptide repeat-containing protein  27.62 
 
 		 356 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  29.07 
 
 		 370 aa  55.1  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  23.92 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  23.31 
 
 		 225 aa  53.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  25.12 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  23.44 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  25.16 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  22.77 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  27.39 
 
 		 356 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  24.1 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  24.43 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  25.47 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  24.62 
 
 		 268 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  25.14 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  23.27 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  26.28 
 
 		 219 aa  51.2  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  25.75 
 
 		 949 aa  50.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  27.75 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  25.87 
 
 		 363 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  26.45 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  23.44 
 
 		 866 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  25.79 
 
 		 846 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2059  pentapeptide repeat-containing protein  24.62 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  22.22 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  25.95 
 
 		 254 aa  49.3  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1891  pentapeptide repeat-containing protein  28.33 
 
 		 356 aa  49.3  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  23.16 
 
 		 881 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  23.21 
 
 		 332 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  23.49 
 
 		 264 aa  49.3  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  23.81 
 
 		 440 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>