More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0649 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  87.16 
 
 		 218 aa  394  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  67.89 
 
 		 218 aa  317  9e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  66.82 
 
 		 217 aa  295  4e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  59.07 
 
 		 216 aa  275  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000904  hypothetical protein  57.21 
 
 		 216 aa  265  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  55.96 
 
 		 218 aa  260  8.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3692  pentapeptide repeat-containing protein  55.96 
 
 		 218 aa  247  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.413415  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  52.94 
 
 		 223 aa  226  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2059  pentapeptide repeat-containing protein  41.83 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  38.65 
 
 		 215 aa  151  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  31.84 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  31.43 
 
 		 261 aa  89.4  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  27.01 
 
 		 600 aa  85.9  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  27.14 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  25.12 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  29.28 
 
 		 449 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  27.67 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  27.19 
 
 		 452 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  27.96 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  28.28 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  27.04 
 
 		 485 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  26.04 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  25.88 
 
 		 309 aa  74.7  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  26.73 
 
 		 320 aa  74.7  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  26.94 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  32.52 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  27.32 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  27.01 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  25.57 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  30.98 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  30.98 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  24.06 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  26.42 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  31.55 
 
 		 870 aa  70.1  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  27.03 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  26.19 
 
 		 333 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  29.86 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  30.77 
 
 		 453 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  27.17 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  26.42 
 
 		 242 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  22.97 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  31.58 
 
 		 446 aa  68.2  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  27.22 
 
 		 521 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  35.2 
 
 		 576 aa  67.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  24.47 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  25.5 
 
 		 567 aa  67.4  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0995  pentapeptide repeat protein  27.23 
 
 		 260 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0411427 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  27.66 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  27.66 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  26.45 
 
 		 174 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  26.2 
 
 		 489 aa  65.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  26.8 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  28.96 
 
 		 517 aa  65.9  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  26.25 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  29.73 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  31.94 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  28.74 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  26 
 
 		 386 aa  65.5  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  29.75 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  24.89 
 
 		 862 aa  65.1  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  25.52 
 
 		 493 aa  64.7  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  28.06 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  29.48 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  31.9 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  27.91 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  24.64 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  23.18 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  24.87 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  29.25 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  30.71 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  27.59 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1181  pentapeptide repeat protein  29.03 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.329473 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  25.42 
 
 		 880 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  31.21 
 
 		 1033 aa  63.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  24.61 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  25.37 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  25.42 
 
 		 880 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  25.42 
 
 		 880 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  26.54 
 
 		 844 aa  62.8  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  22.89 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  26.7 
 
 		 880 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  26.7 
 
 		 877 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  26.67 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  23.81 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  27.18 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  25.42 
 
 		 880 aa  62  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 456 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  27.04 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  24.88 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  28.85 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  23.79 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  23.79 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  25.74 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  26.34 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  27.22 
 
 		 515 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  22.6 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  26.46 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  28.49 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>