230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0867 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
185 aa  364  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  40.59 
 
 
193 aa  131  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  39.41 
 
 
193 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  39.41 
 
 
180 aa  125  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  39.41 
 
 
193 aa  122  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  38.32 
 
 
190 aa  123  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  38.29 
 
 
193 aa  122  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  35.17 
 
 
206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  38.6 
 
 
199 aa  110  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  33.14 
 
 
194 aa  108  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  35.06 
 
 
187 aa  108  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  32.43 
 
 
191 aa  107  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  34.92 
 
 
208 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  32.97 
 
 
190 aa  105  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  34.92 
 
 
265 aa  104  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  36.93 
 
 
205 aa  104  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  36.72 
 
 
225 aa  104  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  36.72 
 
 
220 aa  104  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  34.32 
 
 
197 aa  104  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  34.39 
 
 
208 aa  104  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  36.72 
 
 
220 aa  104  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2591  pentapeptide repeat-containing protein  35.96 
 
 
204 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  36.16 
 
 
220 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  32.74 
 
 
187 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  33.86 
 
 
208 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  32.79 
 
 
192 aa  99  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  34.91 
 
 
196 aa  97.1  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  30.59 
 
 
214 aa  96.7  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  31.79 
 
 
199 aa  91.3  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  31.32 
 
 
195 aa  87  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  27.91 
 
 
186 aa  85.1  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  25.97 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  27.75 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  29.24 
 
 
213 aa  64.7  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  27.82 
 
 
227 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  29.66 
 
 
961 aa  60.5  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  23.2 
 
 
205 aa  59.7  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  24.52 
 
 
183 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  24.52 
 
 
183 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  24.52 
 
 
183 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  27 
 
 
200 aa  58.9  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  24.81 
 
 
225 aa  58.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  30.52 
 
 
211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  24.2 
 
 
234 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  20.79 
 
 
198 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  24.8 
 
 
446 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  25.45 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  28.29 
 
 
211 aa  55.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  28.29 
 
 
211 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  28.29 
 
 
211 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  27.44 
 
 
348 aa  56.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1438  pentapeptide repeat protein  29.27 
 
 
202 aa  55.1  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0273991  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  23.74 
 
 
250 aa  55.5  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  29.29 
 
 
222 aa  55.1  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  23.61 
 
 
206 aa  55.1  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  24.23 
 
 
197 aa  55.1  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  28.95 
 
 
211 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5828  pentapeptide repeat protein  25.35 
 
 
189 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510799  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  21.62 
 
 
191 aa  53.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  21.71 
 
 
227 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35000  uncharacterized low-complexity protein  24.41 
 
 
216 aa  53.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  26.57 
 
 
256 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  27.63 
 
 
211 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  20.48 
 
 
355 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1479  pentapeptide repeat protein  29.6 
 
 
295 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000330683 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  20.19 
 
 
215 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  22.29 
 
 
363 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  26.43 
 
 
734 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  20.22 
 
 
204 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  20.13 
 
 
263 aa  52.4  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  25.4 
 
 
381 aa  51.6  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  26.83 
 
 
600 aa  51.6  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  22.6 
 
 
221 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  24.81 
 
 
367 aa  51.2  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  23.02 
 
 
356 aa  51.2  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  22.07 
 
 
358 aa  51.2  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  24.81 
 
 
367 aa  51.2  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0951  pentapeptide repeat protein  24.46 
 
 
393 aa  50.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  22.6 
 
 
366 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  21.74 
 
 
370 aa  50.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  24.64 
 
 
336 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  23.18 
 
 
384 aa  50.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  24.64 
 
 
336 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  24.43 
 
 
366 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  24.43 
 
 
366 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  22.38 
 
 
350 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  23.72 
 
 
183 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  25.17 
 
 
401 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  27.03 
 
 
452 aa  49.7  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  25.17 
 
 
401 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  23.65 
 
 
515 aa  49.7  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  26.35 
 
 
401 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  25.97 
 
 
190 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  22.98 
 
 
844 aa  49.7  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  30.86 
 
 
229 aa  49.3  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0707  pentapeptide repeat protein  32.14 
 
 
206 aa  49.3  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  20.74 
 
 
259 aa  48.9  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  25.17 
 
 
452 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  23.9 
 
 
450 aa  49.3  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>