238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3302 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
225 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  36.49 
 
 
227 aa  141  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  39.07 
 
 
229 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  36.32 
 
 
229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5828  pentapeptide repeat protein  38.46 
 
 
189 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510799  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1432  pentapeptide repeat protein  37.3 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6181  pentapeptide repeat-containing protein  36.9 
 
 
201 aa  91.7  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.309204  normal  0.0469485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  28.9 
 
 
221 aa  91.7  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3044  pentapeptide repeat protein  31.35 
 
 
253 aa  78.6  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157086  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35000  uncharacterized low-complexity protein  29.26 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2786  hypothetical protein  27.83 
 
 
217 aa  72  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1144  pentapeptide repeat-containing protein  28.06 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  25.33 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  27.67 
 
 
862 aa  62.4  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26860  uncharacterized low-complexity protein  25 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  25.93 
 
 
191 aa  61.6  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  20.94 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  20.94 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  30.59 
 
 
204 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  20.73 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  20.42 
 
 
211 aa  59.3  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2466  pentapeptide repeat-containing protein  24.86 
 
 
220 aa  59.3  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  24.81 
 
 
185 aa  58.5  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  20.73 
 
 
211 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  21.24 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  25.5 
 
 
190 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2954  acetyltransferase, GNAT family  23.13 
 
 
312 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878787  hitchhiker  0.00000560426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1028  pentapeptide repeat-containing protein  24.85 
 
 
180 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.22421  normal  0.0351171 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  29.17 
 
 
452 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2386  hypothetical protein  27.89 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.193618 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  28.9 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 
389 aa  56.6  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2377  acetyltransferase, GNAT family  23.36 
 
 
308 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  26.24 
 
 
401 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  30.82 
 
 
1191 aa  55.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  24.44 
 
 
401 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  26.24 
 
 
401 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  24.64 
 
 
214 aa  55.5  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  28.28 
 
 
215 aa  55.5  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  27.1 
 
 
450 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  29.38 
 
 
183 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  25.2 
 
 
193 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  26.4 
 
 
193 aa  54.7  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  28.39 
 
 
870 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  27.6 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  27.07 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  27.83 
 
 
187 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  22.8 
 
 
442 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  23.89 
 
 
401 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  27.84 
 
 
186 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  28.3 
 
 
412 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  26.92 
 
 
319 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  29.13 
 
 
456 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  22.63 
 
 
197 aa  52.4  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  27.16 
 
 
191 aa  52.4  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3269  pentapeptide repeat-containing protein  23.38 
 
 
228 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  27.78 
 
 
273 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  29.3 
 
 
485 aa  52  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  30.53 
 
 
243 aa  52  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  32 
 
 
370 aa  52  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  24.59 
 
 
576 aa  52  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2940  pentapeptide repeat protein  26.6 
 
 
201 aa  51.6  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  24.4 
 
 
320 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  26.97 
 
 
453 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  26.76 
 
 
447 aa  50.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  26.11 
 
 
515 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  26.42 
 
 
183 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  26.51 
 
 
311 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  26.42 
 
 
183 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  26.42 
 
 
183 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2167  acetyltransferase  20.81 
 
 
308 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  27.63 
 
 
179 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  22.5 
 
 
199 aa  49.7  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  23.83 
 
 
265 aa  49.7  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  22.34 
 
 
381 aa  49.7  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  30.56 
 
 
447 aa  49.7  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  20.43 
 
 
333 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  27.22 
 
 
183 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  28.26 
 
 
232 aa  49.3  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  23.38 
 
 
844 aa  49.3  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2247  acetyltransferase  19.29 
 
 
308 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0012519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2411  acetyltransferase  19.29 
 
 
308 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  25.38 
 
 
356 aa  48.9  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  39.73 
 
 
218 aa  48.9  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  35.04 
 
 
1901 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  24.21 
 
 
197 aa  48.5  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  28.12 
 
 
222 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  26.83 
 
 
218 aa  48.1  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2446  acetyltransferase  26.45 
 
 
308 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.034806  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  25.32 
 
 
825 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  25.12 
 
 
361 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  28.17 
 
 
266 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  26.46 
 
 
351 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  24.1 
 
 
363 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0869  pentapeptide repeat protein  25.45 
 
 
290 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236368  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  25.32 
 
 
825 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  25.32 
 
 
825 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  28.12 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  25.32 
 
 
825 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>