109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_26860 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_26860  uncharacterized low-complexity protein  100 
 
 		 220 aa  438  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2786  hypothetical protein  42.58 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3064  pentapeptide repeat protein  41.79 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3269  pentapeptide repeat-containing protein  41.55 
 
 		 228 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35000  uncharacterized low-complexity protein  35.94 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  33.78 
 
 		 221 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3044  pentapeptide repeat protein  39.2 
 
 		 253 aa  114  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2940  pentapeptide repeat protein  37.06 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2386  hypothetical protein  31.12 
 
 		 199 aa  91.3  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.193618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  26.09 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  24.49 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  25.65 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  25 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  24.78 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6181  pentapeptide repeat-containing protein  27.91 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.309204  normal  0.0469485 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  28.84 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5828  pentapeptide repeat protein  25.66 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510799  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  27.94 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1432  pentapeptide repeat protein  28.49 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  23.5 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  27.49 
 
 		 370 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  24.24 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  22.29 
 
 		 448 aa  52.4  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  24.08 
 
 		 206 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  28.79 
 
 		 727 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  27.07 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  25.67 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  28.7 
 
 		 309 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  22.44 
 
 		 311 aa  49.3  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  23.64 
 
 		 734 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  25.5 
 
 		 949 aa  48.9  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  26.15 
 
 		 250 aa  48.9  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  27.04 
 
 		 452 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  24.18 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  23.27 
 
 		 320 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  26.49 
 
 		 291 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  19.79 
 
 		 601 aa  47.4  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  25.85 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  26.7 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  23.13 
 
 		 866 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1751  pentapeptide repeat-containing protein  26.47 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00861009  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  29.33 
 
 		 416 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  26.32 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  29.31 
 
 		 354 aa  46.2  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  26.11 
 
 		 242 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  25 
 
 		 286 aa  45.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  25.64 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  22.89 
 
 		 872 aa  45.4  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  26.53 
 
 		 351 aa  45.1  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1144  pentapeptide repeat-containing protein  30.89 
 
 		 220 aa  45.1  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  27.14 
 
 		 198 aa  45.1  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  23.48 
 
 		 401 aa  45.1  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  23.48 
 
 		 401 aa  45.1  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  27.04 
 
 		 354 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  27.32 
 
 		 433 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  25.3 
 
 		 776 aa  44.3  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  23.53 
 
 		 262 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  25.81 
 
 		 336 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  26.19 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  22.95 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  25.81 
 
 		 336 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  27.07 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  19.14 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  26.85 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  22.83 
 
 		 880 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 319 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38880  hypothetical protein  26.55 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  21.63 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  27.04 
 
 		 354 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  27.04 
 
 		 354 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  27.04 
 
 		 354 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  27.04 
 
 		 354 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  27.04 
 
 		 354 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  18.52 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  26.67 
 
 		 363 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  25.73 
 
 		 273 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  20.89 
 
 		 294 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  19.14 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  19.14 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  25.43 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  21.71 
 
 		 567 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  22.53 
 
 		 880 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  22.53 
 
 		 880 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  22.78 
 
 		 825 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  22.53 
 
 		 880 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  25.15 
 
 		 452 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  23.84 
 
 		 340 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2673  pentapeptide repeat-containing protein  25.14 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  33.73 
 
 		 1807 aa  42.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  24.66 
 
 		 862 aa  42.7  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  30.77 
 
 		 263 aa  42.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  25 
 
 		 332 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  22.53 
 
 		 877 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3289  pentapeptide repeat containing protein  20.2 
 
 		 237 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.051928  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  24.65 
 
 		 184 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  22.83 
 
 		 846 aa  42.4  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  25.79 
 
 		 356 aa  42  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  22.78 
 
 		 825 aa  42  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  22.22 
 
 		 862 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  22.78 
 
 		 825 aa  42  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>