More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1751 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1751  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
212 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00861009  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0707  pentapeptide repeat protein  34.38 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  29.56 
 
 
381 aa  89  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  31.91 
 
 
449 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  36.54 
 
 
277 aa  88.6  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  30.84 
 
 
294 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  31.14 
 
 
234 aa  85.5  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  31.32 
 
 
278 aa  83.6  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  33.95 
 
 
745 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  30.53 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  31.84 
 
 
1033 aa  80.1  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  33.53 
 
 
420 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  30.73 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  31.48 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  31.77 
 
 
336 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  31.77 
 
 
336 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  31.43 
 
 
389 aa  78.6  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1438  pentapeptide repeat protein  26.52 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0273991  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  34.36 
 
 
1191 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  29.91 
 
 
267 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  30.11 
 
 
734 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  30.73 
 
 
872 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.23 
 
 
525 aa  76.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 
567 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  33.17 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  29.44 
 
 
880 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  29.44 
 
 
880 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  29.73 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  29.44 
 
 
877 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  31.29 
 
 
903 aa  75.9  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  31.91 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  29.44 
 
 
880 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  29.44 
 
 
880 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  37.67 
 
 
447 aa  75.5  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  29.44 
 
 
880 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  30.1 
 
 
311 aa  75.1  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  29.09 
 
 
493 aa  74.3  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  31.52 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  29.45 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  29.87 
 
 
432 aa  74.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  32.91 
 
 
727 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
521 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  30.18 
 
 
366 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  28.96 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  33.94 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  29.79 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  31.36 
 
 
366 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  28.19 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  29.94 
 
 
408 aa  72.4  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  28.41 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  29.41 
 
 
332 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  31.69 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  30.77 
 
 
343 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  28.19 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  30.77 
 
 
343 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  30.91 
 
 
416 aa  72  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  31.37 
 
 
576 aa  71.6  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  30.81 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  27.8 
 
 
489 aa  71.6  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  30.6 
 
 
450 aa  71.2  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  29.27 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  33.75 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  32.32 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  31.41 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  32.34 
 
 
456 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  34.1 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  28.34 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  30.67 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  31.48 
 
 
862 aa  70.1  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  30.93 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  30.49 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  29.21 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  27.63 
 
 
515 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  30.49 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  26.44 
 
 
844 aa  69.7  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  29.95 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  33.55 
 
 
441 aa  69.3  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  32.26 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  31.82 
 
 
870 aa  69.3  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  38.1 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  32.08 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  26.59 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  27.51 
 
 
517 aa  68.9  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  29.67 
 
 
973 aa  68.6  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  31.87 
 
 
299 aa  68.6  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  33.55 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  28.19 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  28.98 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1082  pentapeptide protein  31.76 
 
 
614 aa  67.4  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  30.34 
 
 
706 aa  67.4  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  27.85 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  28.98 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  30.68 
 
 
493 aa  67.8  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.73 
 
 
14916 aa  67.8  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2635  hypothetical protein  30.72 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224677  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5310  pentapeptide repeat protein  34.44 
 
 
264 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  30.34 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  29.12 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0475  pentapeptide repeat-containing protein  31.33 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.019443 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  28.83 
 
 
222 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>