162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1432 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1432  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
228 aa  425  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  37.3 
 
 
225 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6181  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.309204  normal  0.0469485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  31.8 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  29.9 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5828  pentapeptide repeat protein  32.64 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510799  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  29.38 
 
 
229 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  30.13 
 
 
446 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  30.77 
 
 
449 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  28.95 
 
 
311 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  31.65 
 
 
870 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  26.85 
 
 
227 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  35.44 
 
 
872 aa  58.5  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3044  pentapeptide repeat protein  33.52 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157086  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  27.65 
 
 
320 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  27.72 
 
 
452 aa  57.4  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  32.19 
 
 
862 aa  57  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35000  uncharacterized low-complexity protein  31.41 
 
 
216 aa  55.5  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26860  uncharacterized low-complexity protein  28.49 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  29.53 
 
 
1033 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  26.36 
 
 
401 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  29.63 
 
 
355 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  26.36 
 
 
401 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  31.4 
 
 
193 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  36.53 
 
 
381 aa  52  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1479  pentapeptide repeat protein  22.6 
 
 
295 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000330683 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  31.65 
 
 
213 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  28.81 
 
 
333 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  28.91 
 
 
291 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0869  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
290 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236368  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  28.4 
 
 
567 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  30.42 
 
 
433 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  30.86 
 
 
291 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  33.11 
 
 
216 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  28.98 
 
 
381 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  26.35 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  28.08 
 
 
332 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  33.81 
 
 
447 aa  50.1  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  25.79 
 
 
266 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  31.89 
 
 
214 aa  49.7  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1060  pentapeptide repeat-containing protein  30.25 
 
 
157 aa  49.7  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0113174  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  26.14 
 
 
366 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  31.29 
 
 
203 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  30.77 
 
 
165 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  26.03 
 
 
356 aa  48.9  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  25.79 
 
 
356 aa  48.5  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  31.29 
 
 
286 aa  48.5  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  30.17 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  28 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  29.69 
 
 
483 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  25.15 
 
 
343 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  35.25 
 
 
412 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3064  pentapeptide repeat protein  28.92 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  25.15 
 
 
343 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  25.6 
 
 
440 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1533  pentapeptide repeat-containing protein  32.11 
 
 
181 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  30.77 
 
 
206 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  24.18 
 
 
366 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  24.18 
 
 
366 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  24.7 
 
 
734 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  30.77 
 
 
309 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  26.74 
 
 
219 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  31.43 
 
 
880 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1144  pentapeptide repeat-containing protein  28.09 
 
 
220 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  25.56 
 
 
401 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  33.57 
 
 
452 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  22.28 
 
 
447 aa  46.6  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  25.56 
 
 
401 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  25.31 
 
 
489 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  27.14 
 
 
278 aa  46.2  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  31.12 
 
 
250 aa  46.2  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  28.31 
 
 
312 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2409  pentapeptide repeat-containing protein  31.15 
 
 
123 aa  45.8  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  25.49 
 
 
350 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  32.18 
 
 
456 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  27.12 
 
 
300 aa  45.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  21.95 
 
 
601 aa  45.4  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  31.21 
 
 
418 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  30.71 
 
 
880 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  26.24 
 
 
227 aa  45.1  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  31.06 
 
 
199 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  27.35 
 
 
229 aa  45.4  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2142  pentapeptide repeat-containing protein  28.47 
 
 
202 aa  45.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  32.23 
 
 
182 aa  45.1  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  30.71 
 
 
880 aa  45.1  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  30.71 
 
 
880 aa  45.1  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  30.71 
 
 
880 aa  45.1  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  31.28 
 
 
412 aa  45.1  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  29.41 
 
 
517 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  27.4 
 
 
448 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  27.1 
 
 
174 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.36 
 
 
14916 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1956  pentapeptide repeat-containing protein  29.51 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.342311  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  27.86 
 
 
1191 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  27.86 
 
 
336 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  31.28 
 
 
299 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2466  pentapeptide repeat-containing protein  27.6 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  22.75 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  26.47 
 
 
450 aa  44.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  27.86 
 
 
336 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>