72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6181 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6181  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 201 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.309204  normal  0.0469485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  36.9 
 
 		 225 aa  91.7  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  34.29 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  30.33 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  28.57 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5828  pentapeptide repeat protein  34.97 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510799  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1432  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  30.56 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  22.45 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26860  uncharacterized low-complexity protein  27.91 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1533  pentapeptide repeat-containing protein  35.64 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2786  hypothetical protein  31.44 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2466  pentapeptide repeat-containing protein  29.71 
 
 		 220 aa  51.6  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3044  pentapeptide repeat protein  28.89 
 
 		 253 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1144  pentapeptide repeat-containing protein  29.2 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35000  uncharacterized low-complexity protein  25 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  32.52 
 
 		 872 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1028  pentapeptide repeat-containing protein  29.5 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.22421  normal  0.0351171 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  26.05 
 
 		 229 aa  46.2  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  21.34 
 
 		 601 aa  46.2  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 254 aa  46.2  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  21.13 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  21.53 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  21.53 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  37.14 
 
 		 165 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  30.53 
 
 		 825 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  30.15 
 
 		 862 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  24.81 
 
 		 440 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  24.5 
 
 		 881 aa  45.1  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  21.83 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  30.53 
 
 		 825 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0448  pentapeptide repeat-containing protein  23.49 
 
 		 356 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513486  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  30.53 
 
 		 825 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2084  pentapeptide repeat-containing protein  23.49 
 
 		 356 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  26.87 
 
 		 452 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  25.24 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  23.74 
 
 		 844 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1033  pentapeptide repeat-containing protein  23.49 
 
 		 356 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0738  pentapeptide repeat-containing protein  23.49 
 
 		 356 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0799  hypothetical protein  23.49 
 
 		 356 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0711  hypothetical protein  23.49 
 
 		 356 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  27.94 
 
 		 452 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  30.53 
 
 		 825 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2007  pentapeptide repeat-containing protein  23.49 
 
 		 356 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  30.53 
 
 		 825 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  21.83 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  29.73 
 
 		 862 aa  43.5  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  24.42 
 
 		 358 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3923  pentapeptide repeat protein  37.66 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0131528  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  31.72 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  26.13 
 
 		 356 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0992  hypothetical protein  28 
 
 		 119 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2940  pentapeptide repeat protein  29.84 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  30.12 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3874  pentapeptide repeat protein  37.66 
 
 		 152 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  25.27 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  20.57 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  28.68 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  27.12 
 
 		 232 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  21.05 
 
 		 447 aa  42.7  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  30.56 
 
 		 825 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  23.3 
 
 		 442 aa  42  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  19.75 
 
 		 367 aa  42  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  19.75 
 
 		 367 aa  42  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3619  pentapeptide repeat protein  29.56 
 
 		 234 aa  42  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0594601  decreased coverage  0.000131742 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  25.3 
 
 		 1191 aa  41.6  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  27.91 
 
 		 976 aa  41.6  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1891  pentapeptide repeat-containing protein  22.97 
 
 		 356 aa  42  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  24.31 
 
 		 190 aa  41.6  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  23.45 
 
 		 320 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  23.78 
 
 		 576 aa  41.6  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  19.25 
 
 		 186 aa  41.6  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>