More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4376 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 229 aa  463  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  86.9 
 
 		 229 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  35.5 
 
 		 227 aa  138  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  38.92 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5828  pentapeptide repeat protein  39.16 
 
 		 189 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510799  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6181  pentapeptide repeat-containing protein  34.29 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.309204  normal  0.0469485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  23.15 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  30.34 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  30.59 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  29.85 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  31.58 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  28.38 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  26.43 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  24.6 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26860  uncharacterized low-complexity protein  25.65 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  24.34 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  25.38 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  26.21 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  29.12 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  19.68 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  27.91 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  25.64 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  25.47 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  28.26 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  28.98 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1432  pentapeptide repeat protein  29.38 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  22.7 
 
 		 401 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  22.7 
 
 		 401 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1144  pentapeptide repeat-containing protein  27.12 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  28.22 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  27.23 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  27.89 
 
 		 452 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2937  hypothetical protein  35 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.807989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  29.76 
 
 		 485 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  31.78 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  28.11 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  22.7 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  22.29 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2466  pentapeptide repeat-containing protein  26.25 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  27.96 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  22.95 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  20.9 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  27.49 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  20.77 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  21.74 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  27.1 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  27.06 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  25.42 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  20.9 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1028  pentapeptide repeat-containing protein  28.05 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.22421  normal  0.0351171 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  27.65 
 
 		 881 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  29.83 
 
 		 870 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  29.03 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  21.54 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.08 
 
 		 14916 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  28.45 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  22.22 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  26.22 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  23.33 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  23.5 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  20.51 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  26.22 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  30.05 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  31.36 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  31.36 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  28.26 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0448  pentapeptide repeat-containing protein  30.07 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  31.36 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2084  pentapeptide repeat-containing protein  30.07 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0711  hypothetical protein  30.07 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  29.52 
 
 		 872 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0799  hypothetical protein  30.07 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  22.13 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  30.77 
 
 		 844 aa  55.8  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  28.22 
 
 		 493 aa  55.8  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0738  pentapeptide repeat-containing protein  30.07 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2007  pentapeptide repeat-containing protein  30.07 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1033  pentapeptide repeat-containing protein  30.07 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  24.04 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  31.36 
 
 		 360 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  24.04 
 
 		 521 aa  55.1  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  24.26 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  31.36 
 
 		 360 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  31.36 
 
 		 360 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  26.32 
 
 		 320 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  29.56 
 
 		 354 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  29.56 
 
 		 354 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  23.33 
 
 		 363 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  24.63 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  22.02 
 
 		 448 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  29.56 
 
 		 354 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  29.56 
 
 		 354 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  29.56 
 
 		 354 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  28.22 
 
 		 416 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2167  acetyltransferase  22.76 
 
 		 308 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  22.86 
 
 		 309 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  25.62 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  24.55 
 
 		 452 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  27.21 
 
 		 452 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>