More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0869 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0869  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
290 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236368  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  25.56 
 
 
381 aa  77  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  27.24 
 
 
825 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  27.24 
 
 
825 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  27.24 
 
 
825 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  27.24 
 
 
825 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  26.47 
 
 
485 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  24.53 
 
 
286 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  27.67 
 
 
453 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  26.88 
 
 
862 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  28 
 
 
452 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  28.08 
 
 
825 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 
493 aa  69.7  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  29.44 
 
 
825 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  29.09 
 
 
291 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  27.23 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  30.92 
 
 
190 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  27.87 
 
 
710 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.33 
 
 
14916 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  28.1 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  28.85 
 
 
215 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  33.59 
 
 
412 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  28.12 
 
 
846 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  27.38 
 
 
448 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  26.32 
 
 
386 aa  63.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  27.22 
 
 
567 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  34.56 
 
 
635 aa  63.5  0.000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  25.64 
 
 
356 aa  63.5  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  25.13 
 
 
449 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  25.86 
 
 
521 aa  62.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  25.11 
 
 
278 aa  62.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  26.63 
 
 
234 aa  62.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  29.3 
 
 
204 aa  62.8  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  25.45 
 
 
182 aa  62.8  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  25.84 
 
 
866 aa  62.4  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  26.17 
 
 
734 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  29.63 
 
 
216 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  28.4 
 
 
363 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  26.35 
 
 
213 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  28.99 
 
 
433 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  24.78 
 
 
576 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  23.02 
 
 
844 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  21.52 
 
 
880 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  25.36 
 
 
483 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  26.44 
 
 
441 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  21.52 
 
 
880 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  26.06 
 
 
872 aa  60.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  29.51 
 
 
359 aa  60.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  21.52 
 
 
880 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  25.32 
 
 
312 aa  60.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  37.25 
 
 
607 aa  60.5  0.00000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  25.55 
 
 
420 aa  60.1  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  21.52 
 
 
880 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  25.17 
 
 
355 aa  60.1  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  21.52 
 
 
880 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  23.93 
 
 
949 aa  59.7  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  28.03 
 
 
215 aa  59.7  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  24.39 
 
 
267 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  24.5 
 
 
320 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  27.22 
 
 
214 aa  59.3  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  28.96 
 
 
349 aa  59.3  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  27.44 
 
 
233 aa  58.9  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0995  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
260 aa  58.9  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0411427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  26.52 
 
 
489 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  25.52 
 
 
356 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1181  pentapeptide repeat protein  29.14 
 
 
230 aa  58.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.329473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  22.82 
 
 
327 aa  58.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  28.87 
 
 
174 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0362  pentapeptide repeat-containing protein  33.98 
 
 
163 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.571178  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  28.28 
 
 
333 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  26.16 
 
 
336 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  27.27 
 
 
180 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  26.16 
 
 
336 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0517  hypothetical protein  26.99 
 
 
1048 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0493  hypothetical protein  26.83 
 
 
1048 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  28.07 
 
 
189 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4307  pentapeptide repeat-containing protein  31.48 
 
 
182 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.154552  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  21.52 
 
 
877 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  24.19 
 
 
332 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  30.77 
 
 
420 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  22.53 
 
 
881 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  25.56 
 
 
199 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  26.75 
 
 
199 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  30.1 
 
 
194 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  25.91 
 
 
358 aa  57.4  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2505  pentapeptide repeat protein  27.81 
 
 
371 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  29.29 
 
 
1831 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  27.92 
 
 
389 aa  57.4  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  27.65 
 
 
231 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3552  pentapeptide repeat-containing protein  23.2 
 
 
415 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  23.98 
 
 
225 aa  56.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  28.48 
 
 
182 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3601  pentapeptide repeat protein  29.33 
 
 
371 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  29.79 
 
 
254 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  25.73 
 
 
456 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  25.16 
 
 
903 aa  56.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0707  pentapeptide repeat protein  22.53 
 
 
206 aa  56.2  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  25.32 
 
 
351 aa  56.2  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>