More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1220 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 183 aa  362  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 183 aa  362  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 183 aa  362  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  74.59 
 
 		 183 aa  277  6e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  73.45 
 
 		 186 aa  266  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  65.03 
 
 		 183 aa  240  9e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  48.88 
 
 		 206 aa  161  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  46.33 
 
 		 204 aa  156  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  44.51 
 
 		 218 aa  125  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  38.2 
 
 		 197 aa  121  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  38.25 
 
 		 197 aa  117  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  32.57 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  36.99 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  35.39 
 
 		 205 aa  104  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  37.57 
 
 		 201 aa  104  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  33.7 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  36.22 
 
 		 193 aa  97.8  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  34.46 
 
 		 191 aa  94.7  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  31.46 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  35.75 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  35.79 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  32.22 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  34.23 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  34.69 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  32 
 
 		 903 aa  73.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  32.76 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0798  hypothetical protein  23.35 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  30.41 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  25.97 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  31.36 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  25.97 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  27.5 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  25.41 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  25.41 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  31.91 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  34.3 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  25.41 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  37.21 
 
 		 219 aa  67.8  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  31.91 
 
 		 262 aa  67.8  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  31.91 
 
 		 262 aa  67.8  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  24.86 
 
 		 211 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  30.56 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  28.06 
 
 		 174 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 515 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 		 449 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  25.85 
 
 		 381 aa  65.5  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  25.32 
 
 		 340 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  27.72 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  26.32 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  30.77 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  24.86 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  26.86 
 
 		 447 aa  64.3  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  31.82 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  29.38 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  25.9 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 		 497 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  23.81 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  28.96 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  30.57 
 
 		 521 aa  62.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  32.26 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  32.89 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  32.03 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  29.41 
 
 		 213 aa  62  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  26.83 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  24.31 
 
 		 213 aa  62  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  28.83 
 
 		 320 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  25.32 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  30.66 
 
 		 453 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  31.33 
 
 		 866 aa  61.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  26.99 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3289  pentapeptide repeat containing protein  26.47 
 
 		 237 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.051928  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  28.24 
 
 		 493 aa  61.2  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  25.17 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  24.24 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  25.48 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  30.63 
 
 		 489 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  30.66 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  25.66 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  24.71 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  30.49 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  29.8 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  31.29 
 
 		 862 aa  60.1  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  30.37 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  28.3 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  30.07 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3692  pentapeptide repeat-containing protein  24.44 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.413415  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  30.07 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  24.52 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  28.25 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  27.81 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  29.93 
 
 		 485 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  29.48 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  26.78 
 
 		 844 aa  58.9  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  28.81 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  26.06 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  25.42 
 
 		 567 aa  58.9  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  30.99 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  30.61 
 
 		 710 aa  58.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  29.51 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  27.5 
 
 		 370 aa  58.2  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>