159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4064 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  100 
 
 		 265 aa  552  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  80.49 
 
 		 208 aa  360  1e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  80.98 
 
 		 208 aa  360  1e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  79.51 
 
 		 208 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  73.13 
 
 		 205 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  66.06 
 
 		 225 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  68.27 
 
 		 220 aa  308  5e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  68.27 
 
 		 220 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  67.79 
 
 		 220 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  48.95 
 
 		 196 aa  191  9e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  46.63 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  46.56 
 
 		 199 aa  169  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2591  pentapeptide repeat-containing protein  41.88 
 
 		 204 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  43.02 
 
 		 195 aa  148  9e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  35.09 
 
 		 191 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  34.92 
 
 		 185 aa  104  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  31.69 
 
 		 214 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 180 aa  94.7  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  32.14 
 
 		 193 aa  90.9  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  32.74 
 
 		 193 aa  89.7  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  30.81 
 
 		 190 aa  89.7  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  33.7 
 
 		 197 aa  86.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  30.59 
 
 		 190 aa  85.5  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  30.36 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  28.65 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  32.39 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  29.76 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  29.44 
 
 		 187 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  29.9 
 
 		 192 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  27.98 
 
 		 193 aa  72  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  30.41 
 
 		 206 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  26.52 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  27.27 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  27.27 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  26.06 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  26.67 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  24.23 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  25.45 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  26.89 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  26.39 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  25.42 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  27.17 
 
 		 452 aa  59.7  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2141  pentapeptide repeat-containing protein  32.37 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  24.49 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  24.85 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  23.33 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  25.5 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  21.57 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  24.62 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6425  pentapeptide repeat-containing protein  30.58 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.878148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  24.37 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  20.75 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  24.32 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  22.87 
 
 		 949 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  20.21 
 
 		 489 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  23.16 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  23.91 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  23.2 
 
 		 739 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  23.2 
 
 		 739 aa  53.9  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  23.2 
 
 		 739 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  22.66 
 
 		 844 aa  53.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  23.16 
 
 		 193 aa  53.1  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  23.86 
 
 		 485 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  22.17 
 
 		 215 aa  52.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  25 
 
 		 846 aa  52.4  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  28.16 
 
 		 218 aa  52.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  24.21 
 
 		 370 aa  52.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  25.73 
 
 		 825 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  25.73 
 
 		 862 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  25.73 
 
 		 825 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  25.73 
 
 		 825 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  25.73 
 
 		 825 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  25.73 
 
 		 825 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  25.73 
 
 		 825 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  22.22 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  20.92 
 
 		 493 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  21.19 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  24.28 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  24.29 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  23.23 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  23.81 
 
 		 198 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  20.55 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  21.05 
 
 		 332 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  17.65 
 
 		 381 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  21.79 
 
 		 286 aa  49.3  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  25.9 
 
 		 227 aa  49.3  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  22.86 
 
 		 359 aa  49.7  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  25 
 
 		 206 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  24.78 
 
 		 349 aa  49.3  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  23.35 
 
 		 453 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  23.53 
 
 		 976 aa  48.9  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  22.06 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  19.35 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  26.02 
 
 		 197 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  19.66 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  20.62 
 
 		 367 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  23.83 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  20.62 
 
 		 367 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 456 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  21.1 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>