149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3445 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 208 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  98.08 
 
 		 208 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  97.12 
 
 		 208 aa  417  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  80.49 
 
 		 265 aa  360  8e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  75.76 
 
 		 205 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  71.43 
 
 		 220 aa  305  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  71.64 
 
 		 225 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  70.44 
 
 		 220 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  70.44 
 
 		 220 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  50.53 
 
 		 196 aa  191  9e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2591  pentapeptide repeat-containing protein  45.45 
 
 		 204 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  43.59 
 
 		 199 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  44.97 
 
 		 199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  41.9 
 
 		 195 aa  142  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  33.92 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  33.86 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  34.66 
 
 		 180 aa  98.6  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  30.85 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  29.69 
 
 		 190 aa  88.6  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  32.14 
 
 		 193 aa  88.2  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  32.74 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  31.02 
 
 		 194 aa  85.9  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  29.59 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  30.36 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  29.41 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  30.05 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  27.51 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  29.73 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  29.55 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  29.17 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  32.43 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  26.82 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  24.85 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  24.85 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  24.85 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  23.64 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  26.76 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  25.14 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  23.03 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  21.72 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  27.17 
 
 		 452 aa  56.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  24.29 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  22.42 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  24.87 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  21.88 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  25.14 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  22.16 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  23.46 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  25.29 
 
 		 358 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  21.88 
 
 		 367 aa  52.4  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  24.24 
 
 		 363 aa  52.4  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  21.88 
 
 		 367 aa  52.4  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  25.25 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  23.72 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  27 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  21.63 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  22.91 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  21.57 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  26.37 
 
 		 872 aa  49.3  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  24.85 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  23.53 
 
 		 976 aa  48.9  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2141  pentapeptide repeat-containing protein  26.29 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  23.86 
 
 		 846 aa  48.9  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  24.42 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  25.99 
 
 		 370 aa  48.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  22.49 
 
 		 261 aa  48.5  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  23.64 
 
 		 191 aa  48.1  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  23.76 
 
 		 356 aa  48.1  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  20.57 
 
 		 309 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  24.42 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  23.84 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  23.37 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6425  pentapeptide repeat-containing protein  26.67 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.878148 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0448  pentapeptide repeat-containing protein  25.64 
 
 		 356 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513486  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  22.47 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2084  pentapeptide repeat-containing protein  25.64 
 
 		 356 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  21.43 
 
 		 449 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  30.08 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0738  pentapeptide repeat-containing protein  25.64 
 
 		 356 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1033  pentapeptide repeat-containing protein  25.64 
 
 		 356 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  23.53 
 
 		 825 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0799  hypothetical protein  25.64 
 
 		 356 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000904  hypothetical protein  25.81 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0711  hypothetical protein  25.64 
 
 		 356 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2007  pentapeptide repeat-containing protein  25.64 
 
 		 356 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  21.43 
 
 		 886 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  22.55 
 
 		 452 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  22.91 
 
 		 825 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  22.91 
 
 		 862 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  24.69 
 
 		 360 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  24.11 
 
 		 349 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  22.91 
 
 		 825 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  23.98 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  22.91 
 
 		 825 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  24.69 
 
 		 360 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  22.91 
 
 		 825 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  22.91 
 
 		 825 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  24.52 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  25 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  23.78 
 
 		 242 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>