89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A2008 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A2008  hypothetical protein  100 
 
 
738 aa  1505    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0739  hypothetical protein  100 
 
 
738 aa  1505    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1034  hypothetical protein  100 
 
 
738 aa  1505    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0798  hypothetical protein  99.59 
 
 
738 aa  1502    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0710  hypothetical protein  99.46 
 
 
738 aa  1501    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1892  hypothetical protein  95.11 
 
 
716 aa  1403    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2083  hypothetical protein  99.86 
 
 
738 aa  1504    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0447  hypothetical protein  100 
 
 
543 aa  1112    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.414119  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  23.32 
 
 
739 aa  203  7e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  23.32 
 
 
739 aa  203  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  23.32 
 
 
739 aa  203  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  21.2 
 
 
866 aa  78.2  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  19.47 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  27.3 
 
 
862 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  22.48 
 
 
881 aa  72.8  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  27.3 
 
 
825 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  27.3 
 
 
825 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  27.3 
 
 
825 aa  72  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  27.3 
 
 
825 aa  72  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  27.3 
 
 
825 aa  72  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  27.3 
 
 
825 aa  72  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  20.88 
 
 
844 aa  69.3  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  24.45 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  24.45 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0799  hypothetical protein  23.76 
 
 
356 aa  67  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  24.45 
 
 
360 aa  67  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0711  hypothetical protein  23.76 
 
 
356 aa  67  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2007  pentapeptide repeat-containing protein  23.76 
 
 
356 aa  67  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1033  pentapeptide repeat-containing protein  23.76 
 
 
356 aa  67  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  19.82 
 
 
449 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0448  pentapeptide repeat-containing protein  23.76 
 
 
356 aa  67  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513486  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0738  pentapeptide repeat-containing protein  23.76 
 
 
356 aa  67  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2084  pentapeptide repeat-containing protein  23.76 
 
 
356 aa  67  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  23.82 
 
 
360 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  23.82 
 
 
360 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  23.13 
 
 
862 aa  66.2  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  24.33 
 
 
949 aa  66.6  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  23.82 
 
 
360 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  24.09 
 
 
886 aa  65.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  23.65 
 
 
872 aa  63.9  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1891  pentapeptide repeat-containing protein  22.38 
 
 
356 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  20.81 
 
 
367 aa  57.4  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  20.81 
 
 
367 aa  57.4  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  21.35 
 
 
370 aa  55.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  19.94 
 
 
1191 aa  55.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  21.34 
 
 
880 aa  54.3  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  21.34 
 
 
877 aa  54.3  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  21.34 
 
 
880 aa  54.3  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  21.34 
 
 
880 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  21.34 
 
 
880 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  21.34 
 
 
880 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  19.59 
 
 
976 aa  53.5  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  25.44 
 
 
191 aa  52.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  25.71 
 
 
567 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  19.26 
 
 
872 aa  52  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  20.47 
 
 
870 aa  51.6  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  19.45 
 
 
358 aa  50.8  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  20.44 
 
 
355 aa  50.8  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  18.73 
 
 
846 aa  50.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  24.28 
 
 
227 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  23.32 
 
 
199 aa  50.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  25.93 
 
 
229 aa  49.3  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  19.19 
 
 
576 aa  48.9  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  23.95 
 
 
309 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  20.61 
 
 
420 aa  47.8  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  24.92 
 
 
349 aa  47.8  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  23.2 
 
 
186 aa  47.4  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  23.76 
 
 
456 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  32.32 
 
 
187 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  25.56 
 
 
206 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  20.26 
 
 
452 aa  46.6  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  24.18 
 
 
401 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  24.18 
 
 
401 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  19.53 
 
 
359 aa  46.2  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  20.89 
 
 
356 aa  45.8  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  19.21 
 
 
363 aa  46.6  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.53 
 
 
525 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  27.97 
 
 
197 aa  45.8  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0058  pentapeptide repeat-containing protein  26.52 
 
 
205 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108417  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  23.81 
 
 
411 aa  45.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  17.47 
 
 
348 aa  45.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  25.81 
 
 
961 aa  44.7  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  27.14 
 
 
452 aa  44.7  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  20.51 
 
 
493 aa  44.7  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1533  pentapeptide repeat-containing protein  31.31 
 
 
181 aa  44.3  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  23.85 
 
 
205 aa  44.3  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  20.07 
 
 
351 aa  44.3  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3692  pentapeptide repeat-containing protein  32.93 
 
 
218 aa  43.9  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.413415  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  17.43 
 
 
635 aa  43.9  0.01  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>