130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3355 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3355  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 167 aa  344  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6425  pentapeptide repeat-containing protein  53.89 
 
 		 167 aa  197  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.878148 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1408  hypothetical protein  54.49 
 
 		 167 aa  173  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6421  hypothetical protein  54.49 
 
 		 167 aa  173  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  26.76 
 
 		 976 aa  54.7  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0869  pentapeptide repeat protein  25.55 
 
 		 290 aa  54.3  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1438  pentapeptide repeat protein  26.8 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0273991  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  27.07 
 
 		 206 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 		 198 aa  52  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  27.61 
 
 		 197 aa  51.6  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  25.81 
 
 		 191 aa  51.2  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1636  Ion transport 2 domain protein  23.68 
 
 		 366 aa  50.8  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  30.12 
 
 		 739 aa  50.8  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  30.12 
 
 		 739 aa  50.8  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  30.12 
 
 		 739 aa  50.8  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  25.93 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  25.79 
 
 		 872 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  25.56 
 
 		 355 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  28.16 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  23.91 
 
 		 215 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  27.78 
 
 		 193 aa  48.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2569  pentapeptide repeat protein  22.76 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  21.81 
 
 		 452 aa  48.1  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  24.64 
 
 		 197 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  24.34 
 
 		 205 aa  48.1  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  22.35 
 
 		 190 aa  48.1  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  26.95 
 
 		 220 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  24.31 
 
 		 186 aa  47.8  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  26.95 
 
 		 225 aa  47.8  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  26.52 
 
 		 359 aa  47.8  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  26.24 
 
 		 220 aa  47.8  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  28.12 
 
 		 220 aa  47.8  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  23.61 
 
 		 949 aa  47  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  25.83 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  26.25 
 
 		 485 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  27.78 
 
 		 370 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 		 866 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  22.13 
 
 		 227 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  25.76 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1028  pentapeptide repeat-containing protein  25.66 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.22421  normal  0.0351171 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  22.58 
 
 		 191 aa  45.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0798  hypothetical protein  24.83 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  27.41 
 
 		 214 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4879  pentapeptide repeat-containing protein  23.02 
 
 		 657 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.511853 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2836  pentapeptide repeat protein  26.74 
 
 		 368 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  27.41 
 
 		 360 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  23.76 
 
 		 825 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  20.47 
 
 		 381 aa  45.1  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  23.76 
 
 		 862 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  27.41 
 
 		 360 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  27.41 
 
 		 360 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  23.76 
 
 		 825 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  27.41 
 
 		 360 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  23.76 
 
 		 825 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  23.76 
 
 		 825 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  27.41 
 
 		 360 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  23.76 
 
 		 825 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  27.41 
 
 		 360 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  23.76 
 
 		 825 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  23.66 
 
 		 452 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 195 aa  44.7  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  24.77 
 
 		 710 aa  44.7  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  26.87 
 
 		 880 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  26.87 
 
 		 877 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  26.87 
 
 		 880 aa  44.3  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  29.91 
 
 		 218 aa  44.7  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0093  hypothetical protein  23.84 
 
 		 179 aa  44.3  0.0009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  23.53 
 
 		 186 aa  44.3  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  23.7 
 
 		 881 aa  44.3  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  26.83 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  21.19 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  25.93 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  22.9 
 
 		 232 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  26.67 
 
 		 363 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  27.96 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  25.71 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  31.51 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  24.44 
 
 		 453 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0546  pentapeptide repeat-containing protein  31.87 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00958453  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000904  hypothetical protein  24.79 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  22.73 
 
 		 349 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  24.36 
 
 		 600 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  24.82 
 
 		 880 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  24.82 
 
 		 880 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  24.82 
 
 		 880 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  21.82 
 
 		 367 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2466  pentapeptide repeat-containing protein  25.36 
 
 		 220 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  21.82 
 
 		 367 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1529  hypothetical protein  41.67 
 
 		 712 aa  42.4  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000807075 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  27.47 
 
 		 200 aa  42.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2083  hypothetical protein  27.47 
 
 		 738 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  25.49 
 
 		 199 aa  42.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0739  hypothetical protein  27.47 
 
 		 738 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1034  hypothetical protein  27.47 
 
 		 738 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0798  hypothetical protein  27.47 
 
 		 738 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0710  hypothetical protein  27.47 
 
 		 738 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2008  hypothetical protein  27.47 
 
 		 738 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  24.55 
 
 		 200 aa  42.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  26.74 
 
 		 213 aa  42  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  23.91 
 
 		 221 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>