68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0546 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0546  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 180 aa  357  5e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00958453  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  37.66 
 
 		 600 aa  57.8  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  35 
 
 		 267 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  26.47 
 
 		 336 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  26.47 
 
 		 336 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  32.1 
 
 		 250 aa  48.5  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  28.18 
 
 		 862 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  35.71 
 
 		 449 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1219  hypothetical protein  30.49 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  28.18 
 
 		 825 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  30.59 
 
 		 412 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  29.09 
 
 		 825 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  29.09 
 
 		 825 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  29.09 
 
 		 825 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0707  pentapeptide repeat protein  31.68 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  32.1 
 
 		 515 aa  46.2  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  30.12 
 
 		 870 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  34.57 
 
 		 866 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  29.09 
 
 		 825 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  28.18 
 
 		 825 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  32.35 
 
 		 452 aa  45.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1037  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 885 aa  45.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  23.61 
 
 		 172 aa  45.1  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  26.92 
 
 		 299 aa  44.7  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  27.5 
 
 		 412 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  29.89 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  25.24 
 
 		 277 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 		 576 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1438  pentapeptide repeat protein  33.68 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0273991  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1263  hypothetical protein  25.23 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  25.22 
 
 		 266 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2141  pentapeptide repeat-containing protein  29.49 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2409  pentapeptide repeat-containing protein  36.67 
 
 		 885 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  28.28 
 
 		 886 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  25.78 
 
 		 433 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.05 
 
 		 14916 aa  43.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  28.95 
 
 		 452 aa  42.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1328  pentapeptide repeat protein  26.73 
 
 		 929 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000290536  hitchhiker  0.0000145927 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  22.77 
 
 		 229 aa  42.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  30.26 
 
 		 389 aa  42.4  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  23.08 
 
 		 846 aa  42.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  29.41 
 
 		 949 aa  42.4  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1191 aa  42.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  30.68 
 
 		 830 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  29.63 
 
 		 222 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4190  pentapeptide repeat protein  29.29 
 
 		 133 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0869  pentapeptide repeat protein  27.88 
 
 		 290 aa  42.4  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  25.56 
 
 		 286 aa  42.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  27.85 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  30.68 
 
 		 830 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  28.09 
 
 		 255 aa  42  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  29.89 
 
 		 844 aa  42.4  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  36.92 
 
 		 900 aa  42  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  32.61 
 
 		 351 aa  42  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  25.56 
 
 		 184 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  31.88 
 
 		 734 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4086  pentapeptide repeat-containing protein  31.87 
 
 		 1003 aa  42  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.791775  normal  0.807746 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  25.27 
 
 		 446 aa  41.6  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  31.48 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  26.19 
 
 		 340 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  38.6 
 
 		 278 aa  41.2  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  32.99 
 
 		 976 aa  41.2  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  24.18 
 
 		 273 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1181  pentapeptide repeat protein  27.54 
 
 		 230 aa  41.2  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.329473 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2987  pentapeptide repeat protein  38.6 
 
 		 130 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 331 aa  41.2  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2150  hypothetical protein  30 
 
 		 313 aa  41.2  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248984 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>