More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2409 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2408  pentapeptide repeat-containing protein  67.68 
 
 		 881 aa  1132    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2409  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 885 aa  1799    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4086  pentapeptide repeat-containing protein  42.64 
 
 		 1003 aa  283  9e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.791775  normal  0.807746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  30.36 
 
 		 734 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  36.41 
 
 		 286 aa  90.5  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  31.87 
 
 		 493 aa  88.2  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  34.98 
 
 		 309 aa  88.2  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  35.15 
 
 		 449 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  31.71 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  30.53 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  36.27 
 
 		 567 aa  86.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  35.65 
 
 		 343 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  35.65 
 
 		 343 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  45.45 
 
 		 1033 aa  83.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  34.09 
 
 		 862 aa  82  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  34.5 
 
 		 576 aa  80.5  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  34.08 
 
 		 267 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.5 
 
 		 525 aa  80.5  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  34.58 
 
 		 521 aa  79.7  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  35.82 
 
 		 489 aa  80.1  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  35.24 
 
 		 517 aa  80.1  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  34.52 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  31.37 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  29.68 
 
 		 401 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  37.65 
 
 		 745 aa  77.4  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  30.96 
 
 		 291 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  42.34 
 
 		 168 aa  76.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  29.33 
 
 		 401 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  31.89 
 
 		 291 aa  75.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  34.45 
 
 		 311 aa  75.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1107  TPR repeat-containing protein  38.17 
 
 		 266 aa  75.9  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.684682  normal  0.836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  31.58 
 
 		 333 aa  75.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  30.83 
 
 		 285 aa  75.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  40.83 
 
 		 256 aa  75.5  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  32.07 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  34.43 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  33.02 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  32.66 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  30.8 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  30.77 
 
 		 600 aa  74.7  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  33.65 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  30.66 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  31.88 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  33.66 
 
 		 366 aa  74.3  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  32.71 
 
 		 727 aa  73.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  32.43 
 
 		 219 aa  73.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  34.98 
 
 		 441 aa  73.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  30.29 
 
 		 349 aa  73.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  32.12 
 
 		 213 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  29.49 
 
 		 319 aa  73.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  32.34 
 
 		 278 aa  73.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  33.89 
 
 		 446 aa  73.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  35.62 
 
 		 225 aa  72.8  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  30.35 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  31.23 
 
 		 262 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  31.23 
 
 		 1191 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  30.16 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  34.7 
 
 		 214 aa  72  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  29.72 
 
 		 440 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  37.43 
 
 		 277 aa  72.4  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  36.67 
 
 		 152 aa  72.4  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0783  pentapeptide repeat protein  55.42 
 
 		 149 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  34.04 
 
 		 776 aa  72  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  36.46 
 
 		 216 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0810  pentapeptide repeat protein  55.42 
 
 		 149 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  38.89 
 
 		 263 aa  72  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  31.23 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  31.31 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  32.18 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  32.18 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  32.02 
 
 		 419 aa  70.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  31.75 
 
 		 881 aa  70.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  33.69 
 
 		 433 aa  70.9  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2635  hypothetical protein  31.66 
 
 		 245 aa  69.7  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224677  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  32.77 
 
 		 332 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  28.46 
 
 		 401 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  30.42 
 
 		 706 aa  69.7  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  40.83 
 
 		 165 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  28.46 
 
 		 401 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  31.4 
 
 		 320 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  30.93 
 
 		 493 aa  70.1  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  31.92 
 
 		 354 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  31.92 
 
 		 354 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  31.92 
 
 		 354 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  31.92 
 
 		 354 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  35.77 
 
 		 151 aa  69.3  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 		 14916 aa  69.3  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  32.98 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  31.92 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  33.16 
 
 		 710 aa  68.9  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  31.19 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  27.51 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0192  pentapeptide repeat-containing protein  36.64 
 
 		 181 aa  68.2  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493873  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  31.42 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0250  hypothetical protein  37.07 
 
 		 155 aa  68.2  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  34.8 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  31.09 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  34.63 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  29.82 
 
 		 872 aa  67.8  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>