More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4086 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_4086  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 1003 aa  2025    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.791775  normal  0.807746 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2409  pentapeptide repeat-containing protein  42.64 
 
 		 885 aa  283  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2408  pentapeptide repeat-containing protein  43.67 
 
 		 881 aa  274  5.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  35.11 
 
 		 286 aa  91.3  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  32.62 
 
 		 567 aa  85.5  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  34.06 
 
 		 776 aa  84.3  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  33.56 
 
 		 517 aa  84.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  31.82 
 
 		 319 aa  84.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  36.44 
 
 		 449 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  33.08 
 
 		 386 aa  80.1  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.13 
 
 		 525 aa  79.7  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  30.74 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  30.17 
 
 		 381 aa  77.4  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  34.96 
 
 		 521 aa  76.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  30.64 
 
 		 862 aa  75.9  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  33.15 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  30.61 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  30.61 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  32.74 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  29.44 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  29.91 
 
 		 294 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  33.8 
 
 		 412 aa  73.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  32.39 
 
 		 264 aa  73.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  36.32 
 
 		 745 aa  73.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  35.11 
 
 		 576 aa  72.8  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  30.88 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  32.72 
 
 		 311 aa  73.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  27.08 
 
 		 401 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  29.75 
 
 		 1191 aa  72.4  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  26.73 
 
 		 401 aa  72  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  26.73 
 
 		 401 aa  72  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  29.77 
 
 		 213 aa  72  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  32.24 
 
 		 295 aa  72  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  31.31 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  31.88 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  32.77 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  29.57 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  42.11 
 
 		 263 aa  70.5  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  31.56 
 
 		 441 aa  70.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  31.53 
 
 		 225 aa  70.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  26.77 
 
 		 401 aa  70.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  32.41 
 
 		 278 aa  70.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  30.26 
 
 		 266 aa  70.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  31.88 
 
 		 320 aa  70.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  31.31 
 
 		 291 aa  70.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  30.12 
 
 		 493 aa  70.5  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  31.56 
 
 		 234 aa  69.7  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  41.59 
 
 		 213 aa  69.7  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  50.59 
 
 		 331 aa  69.7  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  30.71 
 
 		 336 aa  69.7  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  30.74 
 
 		 515 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1107  TPR repeat-containing protein  39.81 
 
 		 266 aa  69.7  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.684682  normal  0.836 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  30.71 
 
 		 336 aa  69.7  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  29.57 
 
 		 262 aa  68.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  28.81 
 
 		 825 aa  68.9  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  28.81 
 
 		 825 aa  68.9  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  28.81 
 
 		 825 aa  68.9  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  28.81 
 
 		 825 aa  68.9  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  28.81 
 
 		 862 aa  68.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  35.98 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  31.6 
 
 		 870 aa  68.2  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1956  pentapeptide repeat-containing protein  32.39 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.342311  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  31.68 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  33.5 
 
 		 218 aa  67.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  36.87 
 
 		 216 aa  67.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  38.66 
 
 		 250 aa  67.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  39.05 
 
 		 294 aa  67.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  33.03 
 
 		 448 aa  67.8  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2141  pentapeptide repeat-containing protein  31.95 
 
 		 222 aa  67.8  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  37.95 
 
 		 493 aa  67.4  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  26.13 
 
 		 452 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  29.8 
 
 		 734 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  31.87 
 
 		 210 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  38.62 
 
 		 277 aa  66.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  31.75 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  29.06 
 
 		 219 aa  65.9  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 		 256 aa  65.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  35.66 
 
 		 152 aa  65.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  28.4 
 
 		 825 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  29.74 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  28.29 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  38.02 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  35.62 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  37.4 
 
 		 961 aa  64.7  0.000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  26.29 
 
 		 825 aa  64.7  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  30 
 
 		 706 aa  64.7  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  41.58 
 
 		 174 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  26.88 
 
 		 440 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  33.58 
 
 		 384 aa  63.9  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  28.4 
 
 		 949 aa  64.3  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4196  pentapeptide repeat protein  41.51 
 
 		 261 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2272  pentapeptide repeat-containing protein  33.58 
 
 		 681 aa  63.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4156  pentapeptide repeat protein  41.51 
 
 		 261 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  26.39 
 
 		 973 aa  63.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  32.59 
 
 		 268 aa  63.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  28.43 
 
 		 866 aa  63.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  30.96 
 
 		 1033 aa  63.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  34.2 
 
 		 366 aa  63.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  32.73 
 
 		 420 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  30.95 
 
 		 215 aa  63.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>