More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2635 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2635  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  478  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224677  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  40.98 
 
 		 332 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  36.84 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  44.37 
 
 		 1033 aa  96.3  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  41.48 
 
 		 204 aa  95.9  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  40.7 
 
 		 184 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  44.51 
 
 		 381 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  39.11 
 
 		 309 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  36.42 
 
 		 567 aa  91.3  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  40.11 
 
 		 190 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  43.06 
 
 		 745 aa  90.1  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  39.47 
 
 		 449 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  34.34 
 
 		 175 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  46.67 
 
 		 277 aa  88.6  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  39.1 
 
 		 384 aa  88.2  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  33.17 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 493 aa  86.7  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  34.74 
 
 		 401 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  42 
 
 		 286 aa  86.3  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  34.74 
 
 		 401 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  40.13 
 
 		 267 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  38.92 
 
 		 336 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  38.92 
 
 		 336 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  37.11 
 
 		 401 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  41.67 
 
 		 903 aa  85.1  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  41.78 
 
 		 517 aa  85.1  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  40.85 
 
 		 182 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 576 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  41.51 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  39.41 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  33.66 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  39.31 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  39.31 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  36.48 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  40.61 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  34.25 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  42.03 
 
 		 521 aa  83.2  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  42.96 
 
 		 973 aa  82.8  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  39.49 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  36.12 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  34.6 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  38.41 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  39.77 
 
 		 311 aa  82  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  35.98 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  37.28 
 
 		 333 aa  81.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  35.26 
 
 		 189 aa  81.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  40.12 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  33.67 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  33.17 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  37.16 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  41.26 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  40.96 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  41.36 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  36.2 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  35.78 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  36.16 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  32.95 
 
 		 706 aa  79.7  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  31.19 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  37.11 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  36.42 
 
 		 1191 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  38.18 
 
 		 489 aa  78.6  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  34.93 
 
 		 267 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  39.1 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  37.42 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  36.59 
 
 		 493 aa  78.2  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  32.52 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  38.24 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  36.59 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  38.1 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  38.25 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  32.07 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  34.59 
 
 		 862 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  34.1 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  32.34 
 
 		 844 aa  76.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  38.27 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  34.39 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  37.57 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  36.99 
 
 		 710 aa  75.9  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  39.43 
 
 		 420 aa  75.9  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  38.61 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  38.75 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  30.36 
 
 		 448 aa  75.5  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  40.12 
 
 		 452 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  36.02 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  35.8 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  39.05 
 
 		 515 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  30.53 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  34.46 
 
 		 600 aa  74.7  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  38.27 
 
 		 199 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  35.37 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  42.11 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  35.82 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  37.01 
 
 		 727 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1956  pentapeptide repeat-containing protein  37.8 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.342311  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  32.78 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5310  pentapeptide repeat protein  36.76 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  38.6 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  38.6 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1987  pentapeptide repeat-containing protein  47.47 
 
 		 146 aa  73.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  38.27 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>