22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1037 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1037  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 885 aa  1808    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6003  hypothetical protein  35.56 
 
 		 878 aa  423  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  27.62 
 
 		 972 aa  52.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  37.72 
 
 		 1183 aa  51.6  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2549  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  48.15 
 
 		 680 aa  50.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0511571  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  28.22 
 
 		 1733 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  31.06 
 
 		 1699 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  28.4 
 
 		 1652 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6476  serine/threonine protein kinase  47.17 
 
 		 1187 aa  48.5  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  52.27 
 
 		 1858 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  28.93 
 
 		 1553 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6921  hypothetical protein  44.26 
 
 		 659 aa  46.2  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  47.83 
 
 		 1714 aa  45.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  50 
 
 		 1552 aa  46.2  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  26.4 
 
 		 1194 aa  45.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  39.66 
 
 		 214 aa  45.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5262  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1432 aa  45.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435656  hitchhiker  0.00193947 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0546  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 180 aa  45.4  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00958453  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  25.87 
 
 		 1229 aa  45.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  36.51 
 
 		 1032 aa  44.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  31.17 
 
 		 1265 aa  44.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0174  hypothetical protein  39.68 
 
 		 787 aa  44.3  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>