113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6421 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1408  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  337  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6421  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  337  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6425  pentapeptide repeat-containing protein  89.22 
 
 		 167 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.878148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3355  pentapeptide repeat-containing protein  54.49 
 
 		 167 aa  174  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  25.23 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  30.58 
 
 		 265 aa  54.3  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  26.72 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  26.06 
 
 		 846 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  35.94 
 
 		 976 aa  53.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1438  pentapeptide repeat protein  26.95 
 
 		 202 aa  52  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0273991  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  28.46 
 
 		 359 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  25.33 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  28.91 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  29.2 
 
 		 225 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  26.67 
 
 		 208 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  22.43 
 
 		 201 aa  48.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  32.39 
 
 		 193 aa  48.1  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  31.82 
 
 		 739 aa  48.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  31.82 
 
 		 739 aa  48.1  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  31.82 
 
 		 739 aa  48.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  22.97 
 
 		 213 aa  47.8  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2836  pentapeptide repeat protein  25.69 
 
 		 368 aa  47.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  25.36 
 
 		 870 aa  47.8  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  29.89 
 
 		 208 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2350  pentapeptide repeat protein  24.19 
 
 		 147 aa  47.8  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  22.54 
 
 		 206 aa  47.8  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  25.52 
 
 		 233 aa  47.4  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4522  hypothetical protein  31.17 
 
 		 481 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.909404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  30.14 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  26.67 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1190  pentapeptide repeat-containing protein  28 
 
 		 139 aa  47  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0869  pentapeptide repeat protein  25.98 
 
 		 290 aa  47  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  26.61 
 
 		 358 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3074  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.99 
 
 		 851 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.39797e-24 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.79 
 
 		 14916 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  21.33 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  25.2 
 
 		 370 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1181  pentapeptide repeat protein  26.09 
 
 		 230 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.329473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  32.89 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  25.22 
 
 		 263 aa  45.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2466  pentapeptide repeat-containing protein  27.91 
 
 		 220 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  30.99 
 
 		 193 aa  45.8  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  21.54 
 
 		 214 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  25.56 
 
 		 198 aa  45.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  29.89 
 
 		 205 aa  45.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  26.14 
 
 		 200 aa  45.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0093  hypothetical protein  22.83 
 
 		 179 aa  45.1  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  31.08 
 
 		 515 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 825 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  21.84 
 
 		 261 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  24.19 
 
 		 191 aa  44.7  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  22.06 
 
 		 190 aa  44.7  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  21.05 
 
 		 227 aa  44.7  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  31.67 
 
 		 180 aa  44.7  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  25.95 
 
 		 205 aa  44.7  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  27.19 
 
 		 220 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  28.26 
 
 		 862 aa  44.3  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  27.06 
 
 		 196 aa  44.3  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  28.26 
 
 		 825 aa  44.3  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  28.26 
 
 		 825 aa  44.3  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  28.26 
 
 		 825 aa  44.3  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  28.26 
 
 		 825 aa  44.3  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  28.26 
 
 		 825 aa  44.3  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  29.67 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  28.41 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  25.83 
 
 		 367 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  27.37 
 
 		 229 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  25.83 
 
 		 367 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  33.93 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  27.19 
 
 		 220 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  22.02 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  23.89 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  26.14 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  24.55 
 
 		 223 aa  43.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  25 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  29.33 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  27.78 
 
 		 233 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  19.73 
 
 		 213 aa  42.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  25.83 
 
 		 360 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  25.83 
 
 		 360 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  26.83 
 
 		 456 aa  42.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  24.81 
 
 		 242 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2569  pentapeptide repeat protein  22.43 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  22.96 
 
 		 601 aa  42  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  25.83 
 
 		 360 aa  42  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  25.83 
 
 		 360 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  25.83 
 
 		 360 aa  42  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  25.83 
 
 		 360 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  25.38 
 
 		 872 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  27.14 
 
 		 187 aa  42  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  25.76 
 
 		 186 aa  41.6  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1751  pentapeptide repeat-containing protein  26.45 
 
 		 212 aa  41.6  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00861009  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10740  uncharacterized low-complexity protein  28.8 
 
 		 267 aa  41.6  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.678168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  22.35 
 
 		 218 aa  41.6  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  21.62 
 
 		 232 aa  41.6  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  26.32 
 
 		 229 aa  41.2  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 192 aa  41.2  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6181  pentapeptide repeat-containing protein  27.42 
 
 		 201 aa  41.6  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.309204  normal  0.0469485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  21.8 
 
 		 174 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>