36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_10740 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_10740  uncharacterized low-complexity protein  100 
 
 		 267 aa  532  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.678168 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  34.26 
 
 		 350 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  37.84 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  34.04 
 
 		 567 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  33.33 
 
 		 366 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  32.43 
 
 		 354 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  33.33 
 
 		 366 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  28.46 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  30.23 
 
 		 866 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  32.5 
 
 		 215 aa  46.6  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  32.43 
 
 		 354 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  29.57 
 
 		 881 aa  46.2  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  31.4 
 
 		 433 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3601  pentapeptide repeat protein  31.46 
 
 		 371 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  33.33 
 
 		 366 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  33.33 
 
 		 366 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2505  pentapeptide repeat protein  31.46 
 
 		 371 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  31.33 
 
 		 354 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  31.33 
 
 		 354 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  38.03 
 
 		 370 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  31.33 
 
 		 354 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  31.33 
 
 		 354 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4656  pentapeptide repeat protein  30.71 
 
 		 357 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  30.34 
 
 		 872 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  25.41 
 
 		 191 aa  43.9  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  30.63 
 
 		 216 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  27.27 
 
 		 267 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6262  pentapeptide repeat-containing protein  26.36 
 
 		 408 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104366  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  27.33 
 
 		 517 aa  42.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 356 aa  42.7  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  42.7  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  31.67 
 
 		 232 aa  42.7  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 		 355 aa  42.4  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  28.14 
 
 		 349 aa  42.4  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  22.66 
 
 		 381 aa  42.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  29.37 
 
 		 191 aa  42  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>