19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4522 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4522  hypothetical protein  100 
 
 		 481 aa  983    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.909404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  26.96 
 
 		 245 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  30.88 
 
 		 193 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  32.31 
 
 		 193 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  27.85 
 
 		 218 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  23.53 
 
 		 206 aa  47.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  27.82 
 
 		 216 aa  47.4  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  24.68 
 
 		 739 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 193 aa  46.2  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  24.68 
 
 		 739 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  24.68 
 
 		 739 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1636  Ion transport 2 domain protein  22.48 
 
 		 366 aa  45.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  24.63 
 
 		 844 aa  44.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  32.35 
 
 		 193 aa  44.7  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  23.4 
 
 		 229 aa  44.3  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  22.92 
 
 		 976 aa  44.3  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  21.71 
 
 		 213 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  27.12 
 
 		 356 aa  43.5  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6425  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 167 aa  43.1  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.878148 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>