More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0183 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0183  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
170 aa  340  4e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08151  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  340  4e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08391  hypothetical protein  58.24 
 
 
170 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08371  hypothetical protein  58.24 
 
 
170 aa  191  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09851  hypothetical protein  55.88 
 
 
169 aa  191  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.176778 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08061  hypothetical protein  59.15 
 
 
170 aa  191  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0785  hypothetical protein  57.65 
 
 
170 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.859693  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16951  hypothetical protein  47.37 
 
 
198 aa  157  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.62237 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1219  hypothetical protein  45.28 
 
 
169 aa  133  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1263  hypothetical protein  47.71 
 
 
169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17771  pentapeptide repeat-containing protein  39.05 
 
 
182 aa  111  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.114465  normal  0.674203 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0921  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 
182 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2759  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0362  pentapeptide repeat-containing protein  43.31 
 
 
163 aa  108  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.571178  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03791  pentapeptide repeat-containing protein  49.55 
 
 
202 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.48693 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1448  pentapeptide repeat-containing protein  38.55 
 
 
186 aa  104  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4862  pentapeptide repeat-containing protein  38.56 
 
 
164 aa  103  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0592  pentapeptide repeat protein  43.07 
 
 
168 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0575  pentapeptide repeat protein  43.07 
 
 
168 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15511  pentapeptide repeat-containing protein  36.65 
 
 
186 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.121299  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15361  pentapeptide repeat-containing protein  36.65 
 
 
186 aa  98.6  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15111  pentapeptide repeat-containing protein  36.02 
 
 
192 aa  99  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.783575  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2584  pentapeptide repeat protein  37.67 
 
 
171 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.14087  normal  0.252585 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14041  pentapeptide repeat-containing protein  36.73 
 
 
184 aa  97.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.276957  normal  0.0592863 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1840  hypothetical protein  41.8 
 
 
168 aa  97.4  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0702496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4307  pentapeptide repeat-containing protein  38.51 
 
 
182 aa  96.3  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.154552  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1536  hypothetical protein  33.88 
 
 
182 aa  92.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.916018  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1115  pentapeptide repeat protein  43.55 
 
 
168 aa  91.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0856  hypothetical protein  42.98 
 
 
181 aa  91.3  6e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2678  pentapeptide repeat-containing protein  37.06 
 
 
168 aa  90.1  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1185  hypothetical protein  38.22 
 
 
165 aa  90.1  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3470  pentapeptide repeat-containing protein  35.48 
 
 
167 aa  89.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3657  pentapeptide repeat-containing protein  35.26 
 
 
194 aa  88.6  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1361  hypothetical protein  42.15 
 
 
167 aa  86.7  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0734  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 
144 aa  85.1  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.649319 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0229  pentapeptide repeat protein  32.12 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.584528 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3923  pentapeptide repeat protein  36.53 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0131528  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0089  pentapeptide repeat-containing protein  35.19 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0313  hypothetical protein  34.21 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.967815  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3874  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1285  hypothetical protein  38.93 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.967033  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07611  pentapeptide repeat-containing protein  34.59 
 
 
158 aa  79  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  hitchhiker  0.00156438 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07131  pentapeptide repeat-containing protein  38.71 
 
 
156 aa  77  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2129  pentapeptide repeat-containing protein  31.48 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.283688  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_8317  predicted protein  39.47 
 
 
114 aa  75.9  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0135698  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11531  hypothetical protein  34.44 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0502913  normal  0.0854137 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2525  pentapeptide repeat protein  33.71 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_10544  predicted protein  37.01 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00165486  hitchhiker  0.0000000637684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  40.43 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19861  hypothetical protein  31.48 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.028924 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1548  pentapeptide repeat protein  33.71 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105882 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3581  pentapeptide repeat protein  32.58 
 
 
172 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0649  pentapeptide repeat-containing protein  30.77 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07051  pentapeptide repeat-containing protein  30.82 
 
 
157 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.186987  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06761  pentapeptide repeat-containing protein  30.57 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.168299  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16121  hypothetical protein  33.59 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.385195 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11321  hypothetical protein  31.76 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1609  pentapeptide repeat protein  35.48 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2954  pentapeptide repeat protein  33.61 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.916978 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0712  hpothetical protein  31.18 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15481  hypothetical protein  31.18 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11471  hypothetical protein  30.12 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1053  hypothetical protein  30.12 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11461  hypothetical protein  30.12 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07151  pentapeptide repeat-containing protein  32.06 
 
 
157 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.102033  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  28.19 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  30.08 
 
 
145 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0190  pentapeptide repeat protein  36.7 
 
 
244 aa  62  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.37345e-35 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  33.09 
 
 
222 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  31.47 
 
 
222 aa  60.8  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2939  pentapeptide repeat protein  32.59 
 
 
145 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3546  pentapeptide repeat-containing protein  31.47 
 
 
293 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000394958  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3157  pentapeptide repeat protein  32.59 
 
 
145 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.400577  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  39.13 
 
 
277 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  34.53 
 
 
216 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55176  predicted protein  33.09 
 
 
235 aa  59.7  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.21249  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  32.76 
 
 
514 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0207  pentapeptide repeat protein  35.78 
 
 
247 aa  58.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000258172  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  38.64 
 
 
263 aa  58.5  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.27 
 
 
14916 aa  58.5  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  35.79 
 
 
600 aa  58.2  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  32.82 
 
 
309 aa  58.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11313  predicted protein  32.84 
 
 
131 aa  57.8  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.129582  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  32.35 
 
 
222 aa  57.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0415  hypothetical protein  36.36 
 
 
325 aa  57.4  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  36.04 
 
 
286 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2376  pentapeptide repeat-containing protein  31.97 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0340424 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  36.05 
 
 
872 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6262  pentapeptide repeat-containing protein  36.56 
 
 
408 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104366  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  31.31 
 
 
332 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  30.89 
 
 
844 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  31.67 
 
 
354 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 
256 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  38.1 
 
 
336 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  31.93 
 
 
389 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  38.1 
 
 
336 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4156  pentapeptide repeat protein  35.19 
 
 
261 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4196  pentapeptide repeat protein  35.19 
 
 
261 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666213  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  34.23 
 
 
203 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0864  heat shock protein DnaJ-like  33.33 
 
 
217 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0957797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>