More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1115 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1115  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
168 aa  333  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0575  pentapeptide repeat protein  62.28 
 
 
168 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0592  pentapeptide repeat protein  62.28 
 
 
168 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2759  pentapeptide repeat-containing protein  52.69 
 
 
164 aa  158  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4862  pentapeptide repeat-containing protein  53.57 
 
 
164 aa  157  5e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0362  pentapeptide repeat-containing protein  46.2 
 
 
163 aa  134  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.571178  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2584  pentapeptide repeat protein  44.94 
 
 
171 aa  134  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.14087  normal  0.252585 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4307  pentapeptide repeat-containing protein  42.17 
 
 
182 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.154552  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1840  hypothetical protein  46.92 
 
 
168 aa  121  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0702496 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1263  hypothetical protein  41.61 
 
 
169 aa  117  7e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11461  hypothetical protein  40.24 
 
 
172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1053  hypothetical protein  39.77 
 
 
172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11471  hypothetical protein  40.24 
 
 
172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0712  hpothetical protein  39.76 
 
 
184 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15481  hypothetical protein  39.76 
 
 
184 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11321  hypothetical protein  39.41 
 
 
172 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0229  pentapeptide repeat protein  41.56 
 
 
162 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.584528 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09851  hypothetical protein  37.2 
 
 
169 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.176778 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16951  hypothetical protein  42.47 
 
 
198 aa  104  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.62237 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1219  hypothetical protein  43.8 
 
 
169 aa  103  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08061  hypothetical protein  37.89 
 
 
170 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2954  pentapeptide repeat protein  41.35 
 
 
170 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.916978 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08391  hypothetical protein  37.04 
 
 
170 aa  98.2  5e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0785  hypothetical protein  43.44 
 
 
170 aa  97.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.859693  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08371  hypothetical protein  37.04 
 
 
170 aa  97.4  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2678  pentapeptide repeat-containing protein  33.54 
 
 
168 aa  97.4  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2525  pentapeptide repeat protein  36.42 
 
 
172 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3581  pentapeptide repeat protein  35.8 
 
 
172 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1361  hypothetical protein  40.65 
 
 
167 aa  95.1  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1609  pentapeptide repeat protein  36.14 
 
 
174 aa  94.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1536  hypothetical protein  44.63 
 
 
182 aa  93.6  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.916018  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03791  pentapeptide repeat-containing protein  43.22 
 
 
202 aa  93.2  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.48693 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0183  pentapeptide repeat-containing protein  43.55 
 
 
170 aa  92  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08151  hypothetical protein  43.55 
 
 
170 aa  92  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11531  hypothetical protein  36.54 
 
 
183 aa  91.7  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0502913  normal  0.0854137 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19861  hypothetical protein  35.8 
 
 
179 aa  90.1  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.028924 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0856  hypothetical protein  38.31 
 
 
181 aa  89.7  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1185  hypothetical protein  42.4 
 
 
165 aa  89.7  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2129  pentapeptide repeat-containing protein  34.59 
 
 
165 aa  89  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.283688  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3470  pentapeptide repeat-containing protein  36.73 
 
 
167 aa  86.3  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1448  pentapeptide repeat-containing protein  36.14 
 
 
186 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1285  hypothetical protein  40 
 
 
162 aa  85.1  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.967033  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0313  hypothetical protein  39.23 
 
 
170 aa  84.7  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.967815  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0734  pentapeptide repeat-containing protein  39.23 
 
 
144 aa  84.7  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.649319 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15511  pentapeptide repeat-containing protein  34.38 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.121299  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16121  hypothetical protein  38.4 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.385195 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15361  pentapeptide repeat-containing protein  34.38 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15111  pentapeptide repeat-containing protein  34.94 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.783575  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3657  pentapeptide repeat-containing protein  37.6 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14041  pentapeptide repeat-containing protein  33.76 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.276957  normal  0.0592863 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0921  pentapeptide repeat-containing protein  33.54 
 
 
182 aa  77.4  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07611  pentapeptide repeat-containing protein  34.81 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  hitchhiker  0.00156438 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17771  pentapeptide repeat-containing protein  34.55 
 
 
182 aa  77  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.114465  normal  0.674203 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06761  pentapeptide repeat-containing protein  32.91 
 
 
157 aa  77.4  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.168299  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_8317  predicted protein  41.44 
 
 
114 aa  76.6  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0135698  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07051  pentapeptide repeat-containing protein  31.37 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.186987  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0649  pentapeptide repeat-containing protein  32.03 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0089  pentapeptide repeat-containing protein  30.49 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1548  pentapeptide repeat protein  30.36 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105882 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07151  pentapeptide repeat-containing protein  33.59 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.102033  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3923  pentapeptide repeat protein  30.91 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0131528  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55176  predicted protein  37.5 
 
 
235 aa  67  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.21249  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07131  pentapeptide repeat-containing protein  28.86 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_10544  predicted protein  32.52 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00165486  hitchhiker  0.0000000637684 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3874  pentapeptide repeat protein  32.48 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3522  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.894088  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11313  predicted protein  33.33 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.129582  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0415  hypothetical protein  40 
 
 
325 aa  62  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  41.05 
 
 
219 aa  61.6  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  36.97 
 
 
349 aa  60.8  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  34.11 
 
 
442 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  32.43 
 
 
416 aa  57.4  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  35.58 
 
 
343 aa  57.4  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  35.58 
 
 
343 aa  57.4  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  32.28 
 
 
222 aa  57  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0058  pentapeptide repeat-containing protein  40.4 
 
 
205 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108417  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  32.65 
 
 
332 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  36.19 
 
 
870 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  36.73 
 
 
1831 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  36.84 
 
 
215 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  37.11 
 
 
521 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  33.06 
 
 
447 aa  55.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  31.39 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  36.79 
 
 
175 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  35.87 
 
 
204 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  35.92 
 
 
449 aa  54.7  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  35.05 
 
 
309 aa  54.3  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  36.73 
 
 
165 aa  54.3  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  38.38 
 
 
973 aa  53.9  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  36.11 
 
 
745 aa  53.9  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  35 
 
 
358 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  33.9 
 
 
872 aa  53.9  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  29.6 
 
 
825 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  31.85 
 
 
576 aa  53.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  30.4 
 
 
862 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 
299 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  32.82 
 
 
315 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  39.18 
 
 
277 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  33.09 
 
 
710 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_10537  predicted protein  31.2 
 
 
125 aa  53.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0914569  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>