More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1361 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1361  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  338  2e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2525  pentapeptide repeat protein  55.42 
 
 
172 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3581  pentapeptide repeat protein  54.22 
 
 
172 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2678  pentapeptide repeat-containing protein  55.56 
 
 
168 aa  158  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2954  pentapeptide repeat protein  50.7 
 
 
170 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.916978 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0229  pentapeptide repeat protein  46.15 
 
 
162 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.584528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4307  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 
182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.154552  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0856  hypothetical protein  48.51 
 
 
181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1536  hypothetical protein  43.75 
 
 
182 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.916018  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19861  hypothetical protein  45.52 
 
 
179 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.028924 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0362  pentapeptide repeat-containing protein  41.77 
 
 
163 aa  117  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.571178  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2129  pentapeptide repeat-containing protein  40.25 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.283688  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11531  hypothetical protein  42 
 
 
183 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0502913  normal  0.0854137 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0575  pentapeptide repeat protein  45.16 
 
 
168 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0592  pentapeptide repeat protein  45.16 
 
 
168 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2759  pentapeptide repeat-containing protein  41.82 
 
 
164 aa  105  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4862  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 
164 aa  100  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_10544  predicted protein  40.65 
 
 
123 aa  100  9e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00165486  hitchhiker  0.0000000637684 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1219  hypothetical protein  39.88 
 
 
169 aa  98.6  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1185  hypothetical protein  40 
 
 
165 aa  97.1  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0313  hypothetical protein  40.24 
 
 
170 aa  96.7  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.967815  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1053  hypothetical protein  35.71 
 
 
172 aa  95.5  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1115  pentapeptide repeat protein  40.65 
 
 
168 aa  95.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09851  hypothetical protein  35.26 
 
 
169 aa  94  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.176778 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11471  hypothetical protein  35.12 
 
 
172 aa  93.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11461  hypothetical protein  35.12 
 
 
172 aa  93.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0712  hpothetical protein  34.94 
 
 
184 aa  92.8  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15481  hypothetical protein  34.94 
 
 
184 aa  92.8  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_8317  predicted protein  44.74 
 
 
114 aa  92.8  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0135698  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11321  hypothetical protein  34.12 
 
 
172 aa  92.8  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1285  hypothetical protein  42.28 
 
 
162 aa  92.4  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.967033  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16951  hypothetical protein  35.53 
 
 
198 aa  92  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.62237 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08391  hypothetical protein  39.39 
 
 
170 aa  91.7  4e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07611  pentapeptide repeat-containing protein  39.07 
 
 
158 aa  91.3  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  hitchhiker  0.00156438 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3470  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 
167 aa  91.7  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3657  pentapeptide repeat-containing protein  35.53 
 
 
194 aa  90.5  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1263  hypothetical protein  36.69 
 
 
169 aa  90.5  9e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08371  hypothetical protein  39.39 
 
 
170 aa  90.5  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2584  pentapeptide repeat protein  39.84 
 
 
171 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.14087  normal  0.252585 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0785  hypothetical protein  38.64 
 
 
170 aa  88.6  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.859693  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3923  pentapeptide repeat protein  36.75 
 
 
167 aa  87.8  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0131528  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0183  pentapeptide repeat-containing protein  42.15 
 
 
170 aa  87.4  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08151  hypothetical protein  42.15 
 
 
170 aa  87.4  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07151  pentapeptide repeat-containing protein  39.02 
 
 
157 aa  85.9  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.102033  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08061  hypothetical protein  33.12 
 
 
170 aa  85.1  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16121  hypothetical protein  39.69 
 
 
158 aa  85.1  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.385195 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0734  pentapeptide repeat-containing protein  40.56 
 
 
144 aa  83.6  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.649319 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07051  pentapeptide repeat-containing protein  35.95 
 
 
157 aa  84  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.186987  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06761  pentapeptide repeat-containing protein  39.02 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.168299  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03791  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.48693 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0649  pentapeptide repeat-containing protein  34.64 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1609  pentapeptide repeat protein  33.54 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3874  pentapeptide repeat protein  41.32 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1448  pentapeptide repeat-containing protein  38.84 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15511  pentapeptide repeat-containing protein  38.02 
 
 
186 aa  79  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.121299  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15361  pentapeptide repeat-containing protein  36.89 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1840  hypothetical protein  31.54 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0702496 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15111  pentapeptide repeat-containing protein  35.54 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.783575  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32219  predicted protein  34.71 
 
 
156 aa  72  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0417317  normal  0.112837 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55176  predicted protein  34.4 
 
 
235 aa  71.2  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.21249  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1548  pentapeptide repeat protein  35.54 
 
 
172 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105882 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07131  pentapeptide repeat-containing protein  31.71 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0089  pentapeptide repeat-containing protein  27.85 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_10537  predicted protein  35.2 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0914569  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0921  pentapeptide repeat-containing protein  30.83 
 
 
182 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17771  pentapeptide repeat-containing protein  30.83 
 
 
182 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.114465  normal  0.674203 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  34.23 
 
 
389 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  42.27 
 
 
332 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  34.4 
 
 
190 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0707  pentapeptide repeat protein  29.93 
 
 
206 aa  58.2  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  34.09 
 
 
145 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3522  pentapeptide repeat-containing protein  33.98 
 
 
168 aa  57  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.894088  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14041  pentapeptide repeat-containing protein  33.06 
 
 
184 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.276957  normal  0.0592863 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  36.13 
 
 
273 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  37.25 
 
 
277 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 
441 aa  55.1  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0058  pentapeptide repeat-containing protein  36.63 
 
 
205 aa  55.1  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108417  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  41.44 
 
 
517 aa  55.1  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11235  predicted protein  34.91 
 
 
109 aa  55.1  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  38.37 
 
 
278 aa  55.1  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  40.54 
 
 
267 aa  54.3  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  35.23 
 
 
340 aa  53.9  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  30.41 
 
 
219 aa  53.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  32.17 
 
 
222 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
309 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  38.46 
 
 
175 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  31.82 
 
 
245 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11313  predicted protein  33.08 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.129582  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  32.35 
 
 
233 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  32.35 
 
 
233 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  33.01 
 
 
533 aa  52  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  33.04 
 
 
174 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
222 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  38.95 
 
 
1807 aa  52  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  36.67 
 
 
1033 aa  52  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
222 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  32.61 
 
 
241 aa  51.2  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  43.59 
 
 
204 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  31.03 
 
 
734 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  40.86 
 
 
336 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>