41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1348 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1348  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
272 aa  523  1e-147  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  21.79 
 
 
903 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  27.64 
 
 
214 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  21.54 
 
 
452 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0869  pentapeptide repeat protein  22.22 
 
 
233 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0841759  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  20.18 
 
 
412 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  23.45 
 
 
447 aa  49.7  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  25.78 
 
 
450 aa  49.7  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1956  pentapeptide repeat-containing protein  21.71 
 
 
219 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.342311  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0997  pentapeptide repeat protein  20.51 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  28.83 
 
 
193 aa  46.6  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0707  pentapeptide repeat protein  26.89 
 
 
206 aa  46.6  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  20.81 
 
 
245 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  20.77 
 
 
214 aa  45.8  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  23.42 
 
 
336 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  23.42 
 
 
336 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.56 
 
 
525 aa  45.4  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  14.84 
 
 
179 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  20.17 
 
 
408 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  22.05 
 
 
567 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  26.74 
 
 
600 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  20 
 
 
386 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  23.68 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  20.17 
 
 
456 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16951  hypothetical protein  25.74 
 
 
198 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.62237 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1751  pentapeptide repeat-containing protein  20.61 
 
 
212 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00861009  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  27.27 
 
 
218 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5846  hypothetical protein  28.57 
 
 
727 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.909355 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  23.61 
 
 
381 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  22.14 
 
 
245 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  21.82 
 
 
533 aa  43.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1438  pentapeptide repeat protein  28.83 
 
 
202 aa  43.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0273991  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  21.5 
 
 
408 aa  43.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2142  pentapeptide repeat-containing protein  20.78 
 
 
202 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  26.23 
 
 
348 aa  42.7  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  22.83 
 
 
432 aa  42.4  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0192  pentapeptide repeat-containing protein  19.85 
 
 
181 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493873  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  20.93 
 
 
370 aa  42.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1144  pentapeptide repeat-containing protein  23.81 
 
 
220 aa  42.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 
452 aa  42  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  34.07 
 
 
601 aa  42  0.01  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>