More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0691 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0691  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  518  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5479  hypothetical protein  56.7 
 
 		 279 aa  280  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0226407  decreased coverage  0.00750026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2406  pentapeptide repeat-containing protein  58.56 
 
 		 288 aa  263  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28820  uncharacterized low-complexity protein  54.55 
 
 		 298 aa  257  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.190064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2555  pentapeptide repeat-containing protein  56.65 
 
 		 290 aa  254  8e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000219025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4130  pentapeptide repeat-containing protein  51.53 
 
 		 308 aa  246  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745162  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2300  pentapeptide repeat-containing protein  53.18 
 
 		 345 aa  243  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000752712  normal  0.0184634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5950  pentapeptide repeat protein  49.44 
 
 		 289 aa  239  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3394  pentapeptide repeats domain protein  44.7 
 
 		 273 aa  238  9e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3159  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  44.7 
 
 		 273 aa  237  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07960  uncharacterized low-complexity protein  52.67 
 
 		 286 aa  236  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0731853  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1850  pentapeptide repeats domain protein  44.7 
 
 		 273 aa  236  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3381  pentapeptide repeats domain protein  44.7 
 
 		 273 aa  236  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3175  pentapeptide repeat-containing protein  44.7 
 
 		 273 aa  235  6e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3425  pentapeptide repeat-containing protein  44.7 
 
 		 273 aa  235  6e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3099  pentapeptide repeat-containing protein  44.32 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.240608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3406  pentapeptide repeats domain protein  43.94 
 
 		 273 aa  232  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3076  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  43.18 
 
 		 273 aa  229  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5548  pentapeptide repeat protein  48.85 
 
 		 276 aa  222  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262169  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0057  pentapeptide repeat protein  47.1 
 
 		 283 aa  217  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3741  pentapeptide repeat protein  48.12 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2170  pentapeptide repeat protein  49.47 
 
 		 296 aa  205  6e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4358  pentapeptide repeat-containing protein  45.45 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  42.73 
 
 		 447 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5019  pentapeptide repeat-containing protein  54.76 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2559  pentapeptide repeat-containing protein  36.36 
 
 		 163 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  52.04 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  61.9 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  45.53 
 
 		 411 aa  68.9  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1260  pentapeptide repeat-containing protein  37.91 
 
 		 162 aa  68.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  hitchhiker  0.00173599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  52.08 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  37.76 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  34.5 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  51.25 
 
 		 1033 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  65.52 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  58.06 
 
 		 903 aa  65.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3404  pentapeptide repeat-containing protein  58.18 
 
 		 60 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638482  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  50.68 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  36.8 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  48.96 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  43.3 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  50.59 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  37.97 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  38.3 
 
 		 449 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  51.9 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  50.68 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  45.74 
 
 		 524 aa  62.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  48.24 
 
 		 900 aa  62.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  57.63 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  34.66 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  52.78 
 
 		 973 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  51.06 
 
 		 147 aa  62  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  64.52 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0188  pentapeptide repeat-containing protein  46.99 
 
 		 99 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  45.88 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  64.52 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  40.91 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  48.19 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  53.25 
 
 		 143 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  49.28 
 
 		 567 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  40.62 
 
 		 824 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  48.72 
 
 		 521 aa  59.7  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  45 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  46.73 
 
 		 416 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  37.17 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1862  hypothetical protein  43.75 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.833098  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  53.73 
 
 		 600 aa  59.3  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  50.85 
 
 		 517 aa  59.3  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  37.27 
 
 		 706 aa  59.3  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  45.12 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  53.97 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0523  pentapeptide repeat protein  44.07 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.567805  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  64.29 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  60.71 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  60.71 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  35.29 
 
 		 489 aa  58.5  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  54.93 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  44.09 
 
 		 179 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0864  heat shock protein DnaJ-like  55.88 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  53.23 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  55.74 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  53.23 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  41.76 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0869  pentapeptide repeat protein  36.63 
 
 		 233 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0841759  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  47.73 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  50.7 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  56.92 
 
 		 156 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0997  pentapeptide repeat protein  36.63 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  54.55 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1857  pentapeptide repeat-containing protein  39 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  52.86 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  43.84 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  39.55 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  39.17 
 
 		 537 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  34.55 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  52.46 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  51.67 
 
 		 182 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>