288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4358 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4358  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 264 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28820  uncharacterized low-complexity protein  47.17 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.190064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5479  hypothetical protein  46.39 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0226407  decreased coverage  0.00750026 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0691  hypothetical protein  45.45 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2406  pentapeptide repeat-containing protein  49.81 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2555  pentapeptide repeat-containing protein  47.97 
 
 		 290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000219025 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5548  pentapeptide repeat protein  46.99 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262169  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07960  uncharacterized low-complexity protein  47.55 
 
 		 286 aa  189  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0731853  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0057  pentapeptide repeat protein  45.45 
 
 		 283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3099  pentapeptide repeat-containing protein  38.87 
 
 		 284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.240608  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4130  pentapeptide repeat-containing protein  44.27 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745162  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3394  pentapeptide repeats domain protein  38.4 
 
 		 273 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3159  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  38.4 
 
 		 273 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1850  pentapeptide repeats domain protein  37.4 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3175  pentapeptide repeat-containing protein  38.4 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3425  pentapeptide repeat-containing protein  38.4 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2300  pentapeptide repeat-containing protein  45.72 
 
 		 345 aa  178  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000752712  normal  0.0184634 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3406  pentapeptide repeats domain protein  38.4 
 
 		 273 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3076  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  37.64 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2170  pentapeptide repeat protein  47.5 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5950  pentapeptide repeat protein  43.77 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3381  pentapeptide repeats domain protein  37.02 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3741  pentapeptide repeat protein  44.53 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  42.24 
 
 		 1033 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  46.91 
 
 		 900 aa  63.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 		 309 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  55.38 
 
 		 172 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  44.14 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  48.2 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  31.89 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  31.89 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4620  pentapeptide repeat protein  45 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  46.88 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  53.52 
 
 		 973 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 493 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  40.86 
 
 		 286 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0523  pentapeptide repeat protein  63.79 
 
 		 115 aa  57  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.567805  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  43.01 
 
 		 143 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  51.32 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  45 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2772  pentapeptide repeat-containing protein  45.78 
 
 		 129 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  40 
 
 		 408 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 386 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  43.75 
 
 		 903 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4249  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 		 131 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3404  pentapeptide repeat-containing protein  52.63 
 
 		 60 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638482  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  56.06 
 
 		 438 aa  53.9  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  37.31 
 
 		 180 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  46.67 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  38.39 
 
 		 156 aa  53.1  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 		 447 aa  52.8  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  47.44 
 
 		 183 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  35.04 
 
 		 517 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  47.3 
 
 		 862 aa  52.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  44.12 
 
 		 213 aa  52.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  45.95 
 
 		 514 aa  52.4  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  52.63 
 
 		 497 aa  52.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  38.95 
 
 		 537 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  52.05 
 
 		 336 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  33.61 
 
 		 168 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  51.47 
 
 		 1831 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.62 
 
 		 222 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  50.67 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  52.05 
 
 		 336 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  37.63 
 
 		 567 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  40.22 
 
 		 331 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0192  pentapeptide repeat-containing protein  41.56 
 
 		 181 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493873  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  31.68 
 
 		 182 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  36.29 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1286  pentapeptide repeat protein  45.12 
 
 		 318 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635989  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  52.54 
 
 		 147 aa  50.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  39.29 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  44.3 
 
 		 363 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0712  hpothetical protein  35.9 
 
 		 184 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  35.25 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  47.83 
 
 		 870 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 333 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 343 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  39.78 
 
 		 204 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 343 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  46.05 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  41.11 
 
 		 320 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  34.51 
 
 		 450 aa  50.4  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1260  pentapeptide repeat-containing protein  38.79 
 
 		 162 aa  50.4  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  hitchhiker  0.00173599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4134  pentapeptide repeat protein  46.43 
 
 		 137 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.159468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15481  hypothetical protein  35.9 
 
 		 184 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27891  hypothetical protein  48.68 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  44.87 
 
 		 186 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  34.67 
 
 		 493 aa  50.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  42.06 
 
 		 416 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  55.36 
 
 		 179 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  34 
 
 		 449 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  50.63 
 
 		 183 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  41.76 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 		 401 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  41.76 
 
 		 311 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  50.63 
 
 		 183 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  50.63 
 
 		 183 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 206 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>