17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6675 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013731  Slin_6675  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  831    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00251998  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0953  hypothetical protein  26.83 
 
 
731 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0922952  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1470  hypothetical protein  31.18 
 
 
732 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00224315  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1689  hypothetical protein  24.86 
 
 
557 aa  56.2  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1996  hypothetical protein  30.7 
 
 
647 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0882712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0964  hypothetical protein  23.31 
 
 
443 aa  53.5  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111427  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1439  Ion transport 2 domain protein  27.54 
 
 
521 aa  50.4  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841015  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2060  hypothetical protein  25.13 
 
 
727 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.697893  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1176  hypothetical protein  23.68 
 
 
646 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8946  hypothetical protein  28.24 
 
 
351 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00178879  normal  0.674352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2102  hypothetical protein  32.58 
 
 
485 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1073  hypothetical protein  29.79 
 
 
464 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2426  hypothetical protein  23.86 
 
 
704 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0317819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3430  hypothetical protein  25.74 
 
 
296 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1050  hypothetical protein  25.58 
 
 
664 aa  46.2  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8929  hypothetical protein  30.38 
 
 
393 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0590592  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7410  hypothetical protein  22.35 
 
 
375 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>