22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1050 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1050  hypothetical protein  100 
 
 
664 aa  1320    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2426  hypothetical protein  25.23 
 
 
704 aa  89.4  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0317819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1439  Ion transport 2 domain protein  30.96 
 
 
521 aa  87  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841015  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1689  hypothetical protein  23.06 
 
 
557 aa  78.6  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1470  hypothetical protein  26.15 
 
 
732 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00224315  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0964  hypothetical protein  33.33 
 
 
443 aa  76.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111427  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0953  hypothetical protein  27.18 
 
 
731 aa  75.5  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0922952  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0126  hypothetical protein  25.27 
 
 
610 aa  73.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00047965  normal  0.915629 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1996  hypothetical protein  28 
 
 
647 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0882712 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2060  hypothetical protein  24.92 
 
 
727 aa  71.6  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.697893  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2102  hypothetical protein  31.58 
 
 
485 aa  68.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7410  hypothetical protein  34.25 
 
 
375 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0269  hypothetical protein  24.72 
 
 
481 aa  65.1  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3591  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  38.1 
 
 
945 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3283  hypothetical protein  26.35 
 
 
475 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8929  hypothetical protein  31.43 
 
 
393 aa  51.2  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0590592  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8946  hypothetical protein  27.43 
 
 
351 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00178879  normal  0.674352 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1073  hypothetical protein  20.08 
 
 
464 aa  48.9  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3430  hypothetical protein  23.08 
 
 
296 aa  47.8  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6675  hypothetical protein  25.58 
 
 
412 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00251998  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3674  hypothetical protein  21.99 
 
 
438 aa  45.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0475298  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1181  hypothetical protein  29.65 
 
 
295 aa  44.3  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.96487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>