28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6872 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6872  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  723    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7410  hypothetical protein  30.56 
 
 		 375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8946  hypothetical protein  31.05 
 
 		 351 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00178879  normal  0.674352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8929  hypothetical protein  28.43 
 
 		 393 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0590592  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2102  hypothetical protein  30.14 
 
 		 485 aa  86.7  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0964  hypothetical protein  27.3 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3591  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.79 
 
 		 945 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4626  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  30.89 
 
 		 602 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2291  hypothetical protein  24.39 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0775084 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1073  hypothetical protein  24.57 
 
 		 464 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0442  hypothetical protein  29.11 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2150  hypothetical protein  28.52 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0029  hypothetical protein  27.54 
 
 		 300 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  26.67 
 
 		 489 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  23.33 
 
 		 493 aa  53.1  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2426  hypothetical protein  36.79 
 
 		 704 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0317819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3283  hypothetical protein  35.92 
 
 		 475 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1439  Ion transport 2 domain protein  30.84 
 
 		 521 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  28.41 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2836  pentapeptide repeat protein  32.29 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1689  hypothetical protein  32.65 
 
 		 557 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0269  hypothetical protein  30.36 
 
 		 481 aa  46.2  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3427  pentapeptide repeat-containing protein  32.47 
 
 		 365 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3430  hypothetical protein  34.43 
 
 		 296 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  29.82 
 
 		 411 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1992  hypothetical protein  31.22 
 
 		 641 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2060  hypothetical protein  30.93 
 
 		 727 aa  43.9  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.697893  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0126  hypothetical protein  24.12 
 
 		 610 aa  43.1  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00047965  normal  0.915629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>