18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0442 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0442  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  781    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8946  hypothetical protein  28.07 
 
 		 351 aa  116  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00178879  normal  0.674352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8929  hypothetical protein  28.79 
 
 		 393 aa  89.4  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0590592  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7410  hypothetical protein  24.84 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1073  hypothetical protein  33.02 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2102  hypothetical protein  28.17 
 
 		 485 aa  60.1  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6872  hypothetical protein  29.11 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1549  hypothetical protein  37 
 
 		 147 aa  53.5  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0682585  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0964  hypothetical protein  30.86 
 
 		 443 aa  53.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  27.42 
 
 		 411 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  27.8 
 
 		 433 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0029  hypothetical protein  25.11 
 
 		 300 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2836  pentapeptide repeat protein  23.51 
 
 		 368 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2150  hypothetical protein  25.93 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  22.87 
 
 		 362 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5019  pentapeptide repeat-containing protein  42.42 
 
 		 298 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  25.45 
 
 		 493 aa  43.5  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4626  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  37.33 
 
 		 602 aa  43.1  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>