41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0532 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0532  K+ channel, inward rectifier  100 
 
 
303 aa  629  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2009  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  54.58 
 
 
311 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.908322 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3184  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  53.26 
 
 
307 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.203496  normal  0.0915045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2912  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  53.26 
 
 
307 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0588  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  55.3 
 
 
323 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3890  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  54.08 
 
 
320 aa  310  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112226  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4204  K+ channel, inward rectifier, region 2  50.83 
 
 
299 aa  306  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4289  putative inward rectifier potassium channel  47.27 
 
 
323 aa  268  8e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2991  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  47.87 
 
 
321 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0562  inward rectifier potassium channel  44.03 
 
 
520 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.926063  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0395  inward rectifier potassium channel  44.03 
 
 
333 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0376  inward rectifier potassium channel  44.03 
 
 
333 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2854  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  50 
 
 
293 aa  262  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0341  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  45.89 
 
 
305 aa  261  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.496756 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0420  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  45.82 
 
 
319 aa  259  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2059  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  49.23 
 
 
288 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0145  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  44.84 
 
 
313 aa  258  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.974479 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2944  Ion transport 2 domain-containing protein  47.16 
 
 
322 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2330  K+ channel, inward rectifier, region 2  47.16 
 
 
322 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0632805  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2965  Ion transport 2 domain-containing protein  47.16 
 
 
322 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0327  potassium channel protein  43.1 
 
 
532 aa  256  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6296  K+ channel, inward rectifier  46.45 
 
 
320 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110283  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0326  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  46.81 
 
 
305 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0450  putative ATP-sensitive inward rectifier potassium channel related transmembrane protein  43.11 
 
 
307 aa  238  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2113  K+ channel, inward rectifier  39.31 
 
 
304 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0650  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  45.21 
 
 
304 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0311  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  41.26 
 
 
326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434618  normal  0.120793 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  40.38 
 
 
752 aa  211  9e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3013  K+ channel, inward rectifier  43.33 
 
 
311 aa  206  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00097996 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0665  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  37.59 
 
 
317 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0276216  normal  0.0192333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0210  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  34.01 
 
 
330 aa  173  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  0.97527 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4333  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  33.96 
 
 
299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4185  K+ channel, inward rectifier  33.95 
 
 
305 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4338  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  32.84 
 
 
305 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4316  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  32.96 
 
 
305 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49496  predicted protein  24.05 
 
 
526 aa  66.2  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42996  predicted protein  26.23 
 
 
684 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.578593  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0372  Ion transport 2 domain protein  36.36 
 
 
190 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.606309 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  37.5 
 
 
256 aa  43.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1183  Ion transport 2 domain protein  34.21 
 
 
126 aa  42.7  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.993846  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1372  Ion transport 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
268 aa  42.4  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>