20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0372 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0372  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 		 190 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.606309 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 202 aa  48.1  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0098  hypothetical protein  26.77 
 
 		 131 aa  45.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1665  hypothetical protein  47.5 
 
 		 149 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0983304  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3293  hypothetical protein  41.67 
 
 		 141 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0532  K+ channel, inward rectifier  36.36 
 
 		 303 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3241  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2009  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  38.46 
 
 		 311 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.908322 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0755  Ion transport 2 domain-containing protein  32.53 
 
 		 330 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_3676  predicted protein  41.27 
 
 		 277 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.845597  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3025  Ion transport 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 141 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.463861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2458  Ion transport 2 domain-containing protein  39.58 
 
 		 141 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128962  normal  0.806826 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2879  uncharacterized low-complexity protein  31.33 
 
 		 327 aa  42.4  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43530  predicted protein  30.56 
 
 		 356 aa  42.4  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.760626  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1163  Ion transport 2 domain protein  35.71 
 
 		 247 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4491  Ion transport 2 domain protein  31.18 
 
 		 188 aa  42  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0435  Ion transport 2 domain-containing protein  29.25 
 
 		 172 aa  42  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0938  Ion transport 2 domain-containing protein  31.33 
 
 		 327 aa  42  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0839  ion transport 2 domain-containing protein  31.33 
 
 		 327 aa  41.6  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0810  ion transport 2 domain-containing protein  34.92 
 
 		 326 aa  41.6  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>