50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0435 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0435  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 
172 aa  343  5e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948908  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2625  Ion transport 2 domain-containing protein  89.94 
 
 
361 aa  289  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.803406  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1124  Ion transport 2 domain-containing protein  87.41 
 
 
161 aa  251  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759829  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3241  hypothetical protein  50 
 
 
143 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1961  Ion transport 2  43.87 
 
 
160 aa  127  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101403  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0468  Ion transport 2 domain-containing protein  44.6 
 
 
148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370968  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2458  Ion transport 2 domain-containing protein  40.29 
 
 
141 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128962  normal  0.806826 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3293  hypothetical protein  38.85 
 
 
141 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118178  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1665  hypothetical protein  35.14 
 
 
149 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0983304  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3025  Ion transport 2 domain-containing protein  40 
 
 
141 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.463861  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1691  K+ channel, pore region  38.46 
 
 
143 aa  95.5  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.758167  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1493  Ion transport 2  38.84 
 
 
129 aa  87.8  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0306  Ion transport 2 domain-containing protein  38.13 
 
 
148 aa  82  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.408069  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5595  Kef-type K+ transport system-like protein  36.96 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734625  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0395  membrane protein related to Kef-type K+ transport system NAD-binding component  32.24 
 
 
158 aa  67  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.855451  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  29.09 
 
 
202 aa  60.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1933  hypothetical protein  38.75 
 
 
102 aa  59.7  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.162847  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0075  membrane protein, Kef-type K+ transport system NAD-binding component  30.48 
 
 
111 aa  55.8  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1749  Ion transport 2 domain-containing protein  35.96 
 
 
150 aa  53.9  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0607848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2273  Ion transport 2 domain protein  45.28 
 
 
142 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5664  Ion transport 2 domain-containing protein  28.26 
 
 
159 aa  52.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2797  Ion transport 2 domain-containing protein  25.35 
 
 
145 aa  52  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.663377 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2879  uncharacterized low-complexity protein  30 
 
 
327 aa  51.2  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3905  Ion transport 2 domain-containing protein  31 
 
 
132 aa  50.8  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3367  Ion transport 2 domain-containing protein  41.51 
 
 
142 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1713  Ion transport protein  37.36 
 
 
149 aa  48.5  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0380308  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0877  hypothetical protein  27.66 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1179  Ion transport 2  28.24 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00343894  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1581  Ion transport 2 domain-containing protein  34.18 
 
 
262 aa  45.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0810  ion transport 2 domain-containing protein  43.48 
 
 
326 aa  45.1  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0175  Ion transport 2 domain-containing protein  34.75 
 
 
290 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.733026  normal  0.37729 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  36.49 
 
 
271 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0186  Ion transport 2  34.75 
 
 
311 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.877923  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1737  hypothetical protein  35.56 
 
 
157 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.372846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0195  Ion transport 2 domain-containing protein  34.75 
 
 
311 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0755  Ion transport 2 domain-containing protein  42.55 
 
 
330 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1372  Ion transport 2 domain-containing protein  47.62 
 
 
268 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  35.14 
 
 
269 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  34.18 
 
 
282 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0938  Ion transport 2 domain-containing protein  41.46 
 
 
327 aa  42.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167939  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0839  ion transport 2 domain-containing protein  43.9 
 
 
327 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0372  Ion transport 2 domain protein  29.25 
 
 
190 aa  42  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.606309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44180  voltage-dependent potassium channel  35.71 
 
 
149 aa  42  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0536818  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8080  hypothetical protein  84 
 
 
100 aa  41.6  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.363748  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1264  ion transport 2 domain protein  29.79 
 
 
148 aa  41.2  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.345942  normal  0.652381 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1320  Ion transport 2 domain protein  44.9 
 
 
290 aa  41.2  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.615592  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2914  Ion transport 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
136 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2745  Ion transport 2 domain-containing protein  33.93 
 
 
138 aa  40.8  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2823  Ion transport 2 domain-containing protein  33.93 
 
 
138 aa  40.8  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  30.95 
 
 
256 aa  40.8  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.317103 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>