25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5595 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5595  Kef-type K+ transport system-like protein  100 
 
 		 154 aa  310  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0395  membrane protein related to Kef-type K+ transport system NAD-binding component  55.19 
 
 		 158 aa  169  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.855451  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1691  K+ channel, pore region  37.01 
 
 		 143 aa  94.4  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.758167  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1961  Ion transport 2  33.33 
 
 		 160 aa  93.6  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101403  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3241  hypothetical protein  39.67 
 
 		 143 aa  87  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1665  hypothetical protein  34.56 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0983304  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2625  Ion transport 2 domain-containing protein  37.23 
 
 		 361 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.803406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0435  Ion transport 2 domain-containing protein  36.96 
 
 		 172 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2458  Ion transport 2 domain-containing protein  35.43 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128962  normal  0.806826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1124  Ion transport 2 domain-containing protein  36.5 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759829  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3293  hypothetical protein  36.69 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3025  Ion transport 2 domain-containing protein  35.25 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.463861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1493  Ion transport 2  35.25 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0468  Ion transport 2 domain-containing protein  50 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0075  membrane protein, Kef-type K+ transport system NAD-binding component  29.52 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0306  Ion transport 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.408069  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  29.25 
 
 		 202 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2273  Ion transport 2 domain protein  42.11 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3367  Ion transport 2 domain-containing protein  38.6 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4033  hypothetical protein  25.64 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5664  Ion transport 2 domain-containing protein  30 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2797  Ion transport 2 domain-containing protein  31.11 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.663377 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1749  Ion transport 2 domain-containing protein  31.68 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0607848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1933  hypothetical protein  24.73 
 
 		 102 aa  44.3  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.162847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3905  Ion transport 2 domain-containing protein  24.73 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>