49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5664 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5664  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 		 159 aa  321  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3367  Ion transport 2 domain-containing protein  36.09 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1713  Ion transport protein  32.88 
 
 		 149 aa  85.1  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0380308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2914  Ion transport 2 domain-containing protein  30.94 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2273  Ion transport 2 domain protein  34.62 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1749  Ion transport 2 domain-containing protein  32.43 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0607848 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2797  Ion transport 2 domain-containing protein  36.8 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.663377 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2823  Ion transport 2 domain-containing protein  29.5 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2745  Ion transport 2 domain-containing protein  29.5 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44180  voltage-dependent potassium channel  51.56 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0536818  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1737  hypothetical protein  30.82 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.372846  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3905  Ion transport 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4033  hypothetical protein  30.82 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4684  hypothetical protein  34.85 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0831777  normal  0.858819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4596  hypothetical protein  34.85 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4979  hypothetical protein  34.85 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.923465 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0877  hypothetical protein  39.74 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1264  ion transport 2 domain protein  38.46 
 
 		 148 aa  62  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.345942  normal  0.652381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1179  Ion transport 2  42.31 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00343894  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1665  hypothetical protein  36.46 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0983304  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4133  hypothetical protein  42.25 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1961  Ion transport 2  34.41 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101403  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3124  ion transport 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3241  hypothetical protein  34.02 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1124  Ion transport 2 domain-containing protein  28.1 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759829  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  45.1 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2625  Ion transport 2 domain-containing protein  26.95 
 
 		 361 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.803406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0435  Ion transport 2 domain-containing protein  28.26 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948908  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3293  hypothetical protein  32.99 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3025  Ion transport 2 domain-containing protein  29.9 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.463861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1249  Ion transport 2 domain protein  31.82 
 
 		 249 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.940335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2458  Ion transport 2 domain-containing protein  30.93 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128962  normal  0.806826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1106  Ion transport 2 domain-containing protein  30.84 
 
 		 256 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0591  hypothetical protein  27.06 
 
 		 170 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1493  Ion transport 2  34.38 
 
 		 129 aa  48.5  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1691  K+ channel, pore region  31.96 
 
 		 143 aa  48.1  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.758167  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0468  Ion transport 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5595  Kef-type K+ transport system-like protein  30 
 
 		 154 aa  47.4  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4579  Ion transport 2 domain-containing protein  32.14 
 
 		 256 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.29628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5039  Ion transport 2 domain protein  32.14 
 
 		 256 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.103655 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1358  hypothetical protein  23.26 
 
 		 170 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.250908  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1499  Ion transport 2 domain-containing protein  35.09 
 
 		 230 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  31.75 
 
 		 271 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6042  Ion transport 2 domain-containing protein  32.14 
 
 		 256 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0255  ion transport 2 domain-containing protein  30 
 
 		 226 aa  41.2  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106172 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0395  membrane protein related to Kef-type K+ transport system NAD-binding component  27.45 
 
 		 158 aa  40.8  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.855451  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  36.11 
 
 		 251 aa  40.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1933  hypothetical protein  24.75 
 
 		 102 aa  40.4  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.162847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  30.11 
 
 		 517 aa  40.4  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>