42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3367 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3367  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 		 142 aa  288  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2273  Ion transport 2 domain protein  68.57 
 
 		 142 aa  207  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2797  Ion transport 2 domain-containing protein  47.37 
 
 		 145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.663377 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5664  Ion transport 2 domain-containing protein  36.09 
 
 		 159 aa  90.1  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1713  Ion transport protein  30.83 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0380308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1264  ion transport 2 domain protein  30.5 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.345942  normal  0.652381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44180  voltage-dependent potassium channel  47.22 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0536818  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2745  Ion transport 2 domain-containing protein  31.78 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2823  Ion transport 2 domain-containing protein  31.78 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2914  Ion transport 2 domain-containing protein  34.18 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3905  Ion transport 2 domain-containing protein  31.62 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1737  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.372846  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4033  hypothetical protein  29.55 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0877  hypothetical protein  28.43 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3124  ion transport 2 domain-containing protein  28.46 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1749  Ion transport 2 domain-containing protein  26.87 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0607848 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1961  Ion transport 2  32.97 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101403  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3293  hypothetical protein  28.12 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  27.34 
 
 		 202 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1179  Ion transport 2  34.83 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00343894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1124  Ion transport 2 domain-containing protein  38.6 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759829  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3241  hypothetical protein  31.91 
 
 		 143 aa  50.4  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0591  hypothetical protein  31.91 
 
 		 170 aa  50.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0468  Ion transport 2 domain-containing protein  30.53 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2458  Ion transport 2 domain-containing protein  28.12 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128962  normal  0.806826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3025  Ion transport 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.463861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0435  Ion transport 2 domain-containing protein  41.51 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1493  Ion transport 2  30.3 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2625  Ion transport 2 domain-containing protein  42.31 
 
 		 361 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.803406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0962  Ion transport 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.318129  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1358  hypothetical protein  26.4 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.250908  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5595  Kef-type K+ transport system-like protein  38.6 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1691  K+ channel, pore region  32.61 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.758167  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1665  hypothetical protein  30.12 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0983304  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4133  hypothetical protein  29.73 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0395  membrane protein related to Kef-type K+ transport system NAD-binding component  39.66 
 
 		 158 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.855451  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4979  hypothetical protein  32.05 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.923465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4684  hypothetical protein  32.05 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0831777  normal  0.858819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4596  hypothetical protein  32.05 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1933  hypothetical protein  27.27 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.162847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  33.78 
 
 		 222 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1278  hypothetical protein  26.32 
 
 		 171 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>