25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0395 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0395  membrane protein related to Kef-type K+ transport system NAD-binding component  100 
 
 		 158 aa  322  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.855451  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5595  Kef-type K+ transport system-like protein  55.19 
 
 		 154 aa  178  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1961  Ion transport 2  34.69 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101403  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3241  hypothetical protein  36.88 
 
 		 143 aa  87.4  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1691  K+ channel, pore region  34.85 
 
 		 143 aa  83.6  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.758167  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1665  hypothetical protein  34 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0983304  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0435  Ion transport 2 domain-containing protein  32.43 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2458  Ion transport 2 domain-containing protein  35.88 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128962  normal  0.806826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2625  Ion transport 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.803406  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3293  hypothetical protein  35.11 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1493  Ion transport 2  36.8 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3025  Ion transport 2 domain-containing protein  35.77 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.463861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1124  Ion transport 2 domain-containing protein  34.06 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759829  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0468  Ion transport 2 domain-containing protein  36.84 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0306  Ion transport 2 domain-containing protein  37.96 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.408069  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1933  hypothetical protein  29.41 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.162847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0075  membrane protein, Kef-type K+ transport system NAD-binding component  28.57 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3367  Ion transport 2 domain-containing protein  31.96 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  26.72 
 
 		 202 aa  47.4  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2273  Ion transport 2 domain protein  36.67 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1183  Ion transport 2 domain protein  39.22 
 
 		 126 aa  42.4  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.993846  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5664  Ion transport 2 domain-containing protein  29.41 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0877  hypothetical protein  26.92 
 
 		 175 aa  41.2  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1749  Ion transport 2 domain-containing protein  30.3 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0607848 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1179  Ion transport 2  40.82 
 
 		 147 aa  40.4  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00343894  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>