34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1493 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1493  Ion transport 2  100 
 
 		 129 aa  265  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3293  hypothetical protein  63.41 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2458  Ion transport 2 domain-containing protein  63.41 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128962  normal  0.806826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3025  Ion transport 2 domain-containing protein  60.66 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.463861  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1665  hypothetical protein  59.84 
 
 		 149 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0983304  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0306  Ion transport 2 domain-containing protein  59.84 
 
 		 148 aa  145  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.408069  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1961  Ion transport 2  40.32 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101403  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1691  K+ channel, pore region  45.24 
 
 		 143 aa  103  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.758167  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3241  hypothetical protein  38.21 
 
 		 143 aa  96.7  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1124  Ion transport 2 domain-containing protein  38.84 
 
 		 161 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759829  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0468  Ion transport 2 domain-containing protein  36.43 
 
 		 148 aa  88.6  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0435  Ion transport 2 domain-containing protein  38.84 
 
 		 172 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2625  Ion transport 2 domain-containing protein  38.84 
 
 		 361 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.803406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5595  Kef-type K+ transport system-like protein  35.25 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0075  membrane protein, Kef-type K+ transport system NAD-binding component  40.86 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0395  membrane protein related to Kef-type K+ transport system NAD-binding component  35.38 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.855451  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3905  Ion transport 2 domain-containing protein  30.65 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1933  hypothetical protein  29 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.162847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1749  Ion transport 2 domain-containing protein  30.84 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0607848 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3367  Ion transport 2 domain-containing protein  30.3 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2797  Ion transport 2 domain-containing protein  29.31 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.663377 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5664  Ion transport 2 domain-containing protein  34.38 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2273  Ion transport 2 domain protein  32.56 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3770  ion transport 2 domain-containing protein  27.64 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.541985 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4046  ion transport 2 domain-containing protein  27.64 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205691  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3124  ion transport 2 domain-containing protein  32.1 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  39.62 
 
 		 271 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  37.74 
 
 		 269 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  45.65 
 
 		 263 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2879  uncharacterized low-complexity protein  33.8 
 
 		 327 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1372  Ion transport 2 domain-containing protein  46.34 
 
 		 268 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0372  Ion transport 2 domain protein  32.14 
 
 		 190 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.606309 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2957  Ion transport 2 domain protein  30.59 
 
 		 190 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00024289  hitchhiker  0.0035902 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  28.4 
 
 		 202 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>