19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3770 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009957  Dshi_4046  ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 		 145 aa  292  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205691  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3770  ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 		 145 aa  292  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.541985 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1665  hypothetical protein  29.13 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0983304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1493  Ion transport 2  28.46 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3025  Ion transport 2 domain-containing protein  30.4 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.463861  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3293  hypothetical protein  29.79 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2458  Ion transport 2 domain-containing protein  28.26 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128962  normal  0.806826 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1933  hypothetical protein  42.86 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.162847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1749  Ion transport 2 domain-containing protein  27.01 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0607848 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0306  Ion transport 2 domain-containing protein  31.54 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.408069  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0468  Ion transport 2 domain-containing protein  25.58 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3241  hypothetical protein  30.3 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1691  K+ channel, pore region  31.37 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.758167  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1961  Ion transport 2  25.98 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101403  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1124  Ion transport 2 domain-containing protein  26.81 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759829  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0435  Ion transport 2 domain-containing protein  32.31 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2625  Ion transport 2 domain-containing protein  33.93 
 
 		 361 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.803406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5664  Ion transport 2 domain-containing protein  23.91 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03621  hypothetical protein  47.92 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>