37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0468 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0468  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 		 148 aa  290  7e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3241  hypothetical protein  59.71 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1124  Ion transport 2 domain-containing protein  49.64 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759829  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0435  Ion transport 2 domain-containing protein  46.76 
 
 		 172 aa  124  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2625  Ion transport 2 domain-containing protein  46.04 
 
 		 361 aa  121  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.803406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1961  Ion transport 2  42.31 
 
 		 160 aa  117  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101403  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2458  Ion transport 2 domain-containing protein  39.01 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128962  normal  0.806826 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3293  hypothetical protein  39.44 
 
 		 141 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118178  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1665  hypothetical protein  35.66 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0983304  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3025  Ion transport 2 domain-containing protein  40 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.463861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1493  Ion transport 2  36.15 
 
 		 129 aa  98.6  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1691  K+ channel, pore region  34.53 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.758167  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0306  Ion transport 2 domain-containing protein  35.88 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.408069  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5595  Kef-type K+ transport system-like protein  32.79 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0395  membrane protein related to Kef-type K+ transport system NAD-binding component  36.84 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.855451  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1933  hypothetical protein  35.56 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.162847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1749  Ion transport 2 domain-containing protein  32.22 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0607848 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0075  membrane protein, Kef-type K+ transport system NAD-binding component  30.61 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3367  Ion transport 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2273  Ion transport 2 domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2797  Ion transport 2 domain-containing protein  30.68 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.663377 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  30.3 
 
 		 202 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5664  Ion transport 2 domain-containing protein  28.21 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1264  ion transport 2 domain protein  27.56 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.345942  normal  0.652381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1179  Ion transport 2  25 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00343894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3905  Ion transport 2 domain-containing protein  26.19 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3770  ion transport 2 domain-containing protein  33.87 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.541985 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4046  ion transport 2 domain-containing protein  33.87 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205691  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2879  uncharacterized low-complexity protein  46.15 
 
 		 327 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0810  ion transport 2 domain-containing protein  46.15 
 
 		 326 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0457  Ion transport 2 domain-containing protein  43.14 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0447878  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0839  ion transport 2 domain-containing protein  43.59 
 
 		 327 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0938  Ion transport 2 domain-containing protein  41.03 
 
 		 327 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2914  Ion transport 2 domain-containing protein  29.82 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3013  K+ channel, inward rectifier  33.33 
 
 		 311 aa  40.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00097996 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2823  Ion transport 2 domain-containing protein  29.82 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2745  Ion transport 2 domain-containing protein  29.82 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>