38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1264 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1264  ion transport 2 domain protein  100 
 
 		 148 aa  288  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.345942  normal  0.652381 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1749  Ion transport 2 domain-containing protein  33.09 
 
 		 150 aa  90.9  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0607848 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1179  Ion transport 2  37.84 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00343894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44180  voltage-dependent potassium channel  35 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0536818  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1713  Ion transport protein  29.55 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0380308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3367  Ion transport 2 domain-containing protein  30.5 
 
 		 142 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2797  Ion transport 2 domain-containing protein  36.11 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.663377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2273  Ion transport 2 domain protein  40.24 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5664  Ion transport 2 domain-containing protein  38.46 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1737  hypothetical protein  28.79 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.372846  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2914  Ion transport 2 domain-containing protein  30.7 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3905  Ion transport 2 domain-containing protein  39.02 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0877  hypothetical protein  26.32 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2823  Ion transport 2 domain-containing protein  30.95 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2745  Ion transport 2 domain-containing protein  30.95 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3124  ion transport 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1961  Ion transport 2  32.69 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101403  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3241  hypothetical protein  44 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4133  hypothetical protein  24.16 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4596  hypothetical protein  27.86 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4979  hypothetical protein  27.86 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.923465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4684  hypothetical protein  27.86 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0831777  normal  0.858819 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3293  hypothetical protein  33 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0698  hypothetical protein  29.09 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4033  hypothetical protein  27.13 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1654  Ion transport 2 domain-containing protein  46.67 
 
 		 235 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.773346  normal  0.437872 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1124  Ion transport 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759829  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2458  Ion transport 2 domain-containing protein  33.72 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128962  normal  0.806826 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0468  Ion transport 2 domain-containing protein  27.56 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1691  K+ channel, pore region  27.88 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.758167  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3025  Ion transport 2 domain-containing protein  30 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.463861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  26.92 
 
 		 202 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0962  Ion transport 2 domain-containing protein  26.6 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.318129  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41686  VIC family transporter: inwardly rectifying potassium ion channel  33.73 
 
 		 648 aa  41.6  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0173475  decreased coverage  0.000449346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0435  Ion transport 2 domain-containing protein  29.79 
 
 		 172 aa  41.2  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0075  membrane protein, Kef-type K+ transport system NAD-binding component  28.32 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1278  hypothetical protein  27.94 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  32.69 
 
 		 470 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>